Protein–RNA interactions for Protein: P0C192

Lrrc4b, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc4bP0C192 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Lrrc4bP0C192 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lrrc4bP0C192 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Lrrc4bP0C192 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lrrc4bP0C192 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lrrc4bP0C192 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lrrc4bP0C192 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lrrc4bP0C192 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lrrc4bP0C192 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lrrc4bP0C192 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lrrc4bP0C192 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lrrc4bP0C192 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lrrc4bP0C192 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lrrc4bP0C192 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lrrc4bP0C192 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lrrc4bP0C192 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lrrc4bP0C192 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lrrc4bP0C192 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lrrc4bP0C192 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrc4bP0C192 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrc4bP0C192 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lrrc4bP0C192 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lrrc4bP0C192 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Lrrc4bP0C192 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lrrc4bP0C192 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lrrc4bP0C192 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lrrc4bP0C192 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lrrc4bP0C192 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrrc4bP0C192 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrrc4bP0C192 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrrc4bP0C192 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrrc4bP0C192 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrrc4bP0C192 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrrc4bP0C192 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrrc4bP0C192 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrrc4bP0C192 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lrrc4bP0C192 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lrrc4bP0C192 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lrrc4bP0C192 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lrrc4bP0C192 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lrrc4bP0C192 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrrc4bP0C192 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Lrrc4bP0C192 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lrrc4bP0C192 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lrrc4bP0C192 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lrrc4bP0C192 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lrrc4bP0C192 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lrrc4bP0C192 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lrrc4bP0C192 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lrrc4bP0C192 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lrrc4bP0C192 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lrrc4bP0C192 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lrrc4bP0C192 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lrrc4bP0C192 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lrrc4bP0C192 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrrc4bP0C192 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrrc4bP0C192 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrrc4bP0C192 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrrc4bP0C192 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrrc4bP0C192 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrrc4bP0C192 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrrc4bP0C192 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Lrrc4bP0C192 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lrrc4bP0C192 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrrc4bP0C192 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrrc4bP0C192 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrrc4bP0C192 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrrc4bP0C192 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrrc4bP0C192 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrrc4bP0C192 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrrc4bP0C192 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrrc4bP0C192 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrrc4bP0C192 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrrc4bP0C192 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrc4bP0C192 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrc4bP0C192 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrc4bP0C192 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrc4bP0C192 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrrc4bP0C192 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrrc4bP0C192 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrrc4bP0C192 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrrc4bP0C192 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lrrc4bP0C192 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lrrc4bP0C192 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrc4bP0C192 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrc4bP0C192 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrc4bP0C192 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrc4bP0C192 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrc4bP0C192 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrc4bP0C192 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrc4bP0C192 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrc4bP0C192 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrc4bP0C192 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrc4bP0C192 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrc4bP0C192 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrc4bP0C192 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrc4bP0C192 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrc4bP0C192 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrc4bP0C192 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Lrrc4bP0C192 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms