Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gcom1E9PZ54 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gcom1E9PZ54 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gcom1E9PZ54 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gcom1E9PZ54 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gcom1E9PZ54 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gcom1E9PZ54 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gcom1E9PZ54 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gcom1E9PZ54 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gcom1E9PZ54 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gcom1E9PZ54 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gcom1E9PZ54 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gcom1E9PZ54 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gcom1E9PZ54 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gcom1E9PZ54 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gcom1E9PZ54 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gcom1E9PZ54 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gcom1E9PZ54 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gcom1E9PZ54 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gcom1E9PZ54 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gcom1E9PZ54 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gcom1E9PZ54 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gcom1E9PZ54 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gcom1E9PZ54 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gcom1E9PZ54 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gcom1E9PZ54 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gcom1E9PZ54 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gcom1E9PZ54 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gcom1E9PZ54 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gcom1E9PZ54 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gcom1E9PZ54 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gcom1E9PZ54 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gcom1E9PZ54 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gcom1E9PZ54 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gcom1E9PZ54 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gcom1E9PZ54 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gcom1E9PZ54 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gcom1E9PZ54 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gcom1E9PZ54 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gcom1E9PZ54 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gcom1E9PZ54 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gcom1E9PZ54 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gcom1E9PZ54 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gcom1E9PZ54 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gcom1E9PZ54 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gcom1E9PZ54 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gcom1E9PZ54 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gcom1E9PZ54 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gcom1E9PZ54 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gcom1E9PZ54 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gcom1E9PZ54 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gcom1E9PZ54 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gcom1E9PZ54 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gcom1E9PZ54 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gcom1E9PZ54 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gcom1E9PZ54 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gcom1E9PZ54 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Gcom1E9PZ54 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Gcom1E9PZ54 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gcom1E9PZ54 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gcom1E9PZ54 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gcom1E9PZ54 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gcom1E9PZ54 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gcom1E9PZ54 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gcom1E9PZ54 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gcom1E9PZ54 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Gcom1E9PZ54 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gcom1E9PZ54 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gcom1E9PZ54 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gcom1E9PZ54 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gcom1E9PZ54 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gcom1E9PZ54 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gcom1E9PZ54 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gcom1E9PZ54 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gcom1E9PZ54 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gcom1E9PZ54 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gcom1E9PZ54 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gcom1E9PZ54 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gcom1E9PZ54 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gcom1E9PZ54 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gcom1E9PZ54 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gcom1E9PZ54 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gcom1E9PZ54 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gcom1E9PZ54 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gcom1E9PZ54 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gcom1E9PZ54 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gcom1E9PZ54 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gcom1E9PZ54 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gcom1E9PZ54 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gcom1E9PZ54 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gcom1E9PZ54 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gcom1E9PZ54 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gcom1E9PZ54 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gcom1E9PZ54 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gcom1E9PZ54 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gcom1E9PZ54 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gcom1E9PZ54 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gcom1E9PZ54 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gcom1E9PZ54 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gcom1E9PZ54 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156 ms