Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc13D3YV10 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc13D3YV10 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc13D3YV10 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc13D3YV10 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc13D3YV10 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc13D3YV10 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc13D3YV10 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc13D3YV10 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc13D3YV10 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc13D3YV10 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc13D3YV10 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc13D3YV10 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc13D3YV10 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc13D3YV10 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc13D3YV10 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc13D3YV10 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc13D3YV10 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc13D3YV10 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc13D3YV10 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc13D3YV10 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc13D3YV10 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc13D3YV10 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc13D3YV10 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc13D3YV10 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc13D3YV10 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc13D3YV10 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc13D3YV10 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc13D3YV10 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc13D3YV10 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc13D3YV10 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc13D3YV10 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc13D3YV10 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc13D3YV10 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc13D3YV10 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc13D3YV10 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc13D3YV10 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc13D3YV10 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc13D3YV10 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc13D3YV10 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc13D3YV10 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc13D3YV10 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc13D3YV10 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc13D3YV10 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc13D3YV10 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc13D3YV10 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc13D3YV10 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc13D3YV10 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc13D3YV10 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc13D3YV10 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc13D3YV10 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc13D3YV10 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc13D3YV10 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc13D3YV10 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc13D3YV10 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc13D3YV10 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc13D3YV10 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc13D3YV10 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc13D3YV10 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc13D3YV10 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc13D3YV10 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc13D3YV10 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc13D3YV10 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc13D3YV10 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc13D3YV10 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc13D3YV10 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc13D3YV10 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc13D3YV10 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc13D3YV10 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc13D3YV10 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc13D3YV10 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc13D3YV10 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc13D3YV10 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc13D3YV10 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc13D3YV10 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc13D3YV10 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc13D3YV10 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc13D3YV10 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc13D3YV10 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc13D3YV10 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc13D3YV10 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc13D3YV10 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc13D3YV10 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc13D3YV10 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc13D3YV10 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc13D3YV10 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc13D3YV10 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc13D3YV10 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc13D3YV10 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc13D3YV10 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc13D3YV10 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc13D3YV10 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc13D3YV10 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc13D3YV10 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc13D3YV10 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc13D3YV10 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc13D3YV10 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc13D3YV10 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc13D3YV10 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc13D3YV10 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms