Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms