Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms