Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms