Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RRN3P1Q2M238 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RRN3P1Q2M238 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RRN3P1Q2M238 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RRN3P1Q2M238 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RRN3P1Q2M238 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RRN3P1Q2M238 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RRN3P1Q2M238 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RRN3P1Q2M238 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RRN3P1Q2M238 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RRN3P1Q2M238 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RRN3P1Q2M238 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RRN3P1Q2M238 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RRN3P1Q2M238 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RRN3P1Q2M238 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RRN3P1Q2M238 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RRN3P1Q2M238 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RRN3P1Q2M238 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RRN3P1Q2M238 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RRN3P1Q2M238 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RRN3P1Q2M238 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RRN3P1Q2M238 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RRN3P1Q2M238 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RRN3P1Q2M238 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RRN3P1Q2M238 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RRN3P1Q2M238 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
RRN3P1Q2M238 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RRN3P1Q2M238 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RRN3P1Q2M238 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RRN3P1Q2M238 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RRN3P1Q2M238 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RRN3P1Q2M238 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RRN3P1Q2M238 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RRN3P1Q2M238 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RRN3P1Q2M238 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RRN3P1Q2M238 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RRN3P1Q2M238 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RRN3P1Q2M238 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RRN3P1Q2M238 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RRN3P1Q2M238 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RRN3P1Q2M238 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RRN3P1Q2M238 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RRN3P1Q2M238 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RRN3P1Q2M238 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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RRN3P1Q2M238 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RRN3P1Q2M238 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RRN3P1Q2M238 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RRN3P1Q2M238 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RRN3P1Q2M238 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RRN3P1Q2M238 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RRN3P1Q2M238 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RRN3P1Q2M238 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RRN3P1Q2M238 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RRN3P1Q2M238 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RRN3P1Q2M238 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RRN3P1Q2M238 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RRN3P1Q2M238 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RRN3P1Q2M238 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RRN3P1Q2M238 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RRN3P1Q2M238 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RRN3P1Q2M238 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RRN3P1Q2M238 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RRN3P1Q2M238 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RRN3P1Q2M238 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RRN3P1Q2M238 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RRN3P1Q2M238 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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RRN3P1Q2M238 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RRN3P1Q2M238 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RRN3P1Q2M238 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RRN3P1Q2M238 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RRN3P1Q2M238 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RRN3P1Q2M238 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RRN3P1Q2M238 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RRN3P1Q2M238 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RRN3P1Q2M238 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RRN3P1Q2M238 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RRN3P1Q2M238 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RRN3P1Q2M238 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RRN3P1Q2M238 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RRN3P1Q2M238 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RRN3P1Q2M238 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RRN3P1Q2M238 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RRN3P1Q2M238 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RRN3P1Q2M238 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RRN3P1Q2M238 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RRN3P1Q2M238 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RRN3P1Q2M238 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RRN3P1Q2M238 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RRN3P1Q2M238 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RRN3P1Q2M238 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RRN3P1Q2M238 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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