Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2E1P29083 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms