Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prf1P10820 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Prf1P10820 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Prf1P10820 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prf1P10820 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prf1P10820 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prf1P10820 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Prf1P10820 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms