Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CGGBP1Q9UFW8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CGGBP1Q9UFW8 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CGGBP1Q9UFW8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CGGBP1Q9UFW8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CGGBP1Q9UFW8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CGGBP1Q9UFW8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CGGBP1Q9UFW8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CGGBP1Q9UFW8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CGGBP1Q9UFW8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CGGBP1Q9UFW8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CGGBP1Q9UFW8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CGGBP1Q9UFW8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CGGBP1Q9UFW8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CGGBP1Q9UFW8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CGGBP1Q9UFW8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CGGBP1Q9UFW8 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CGGBP1Q9UFW8 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
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