Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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HIF1AQ16665 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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HIF1AQ16665 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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HIF1AQ16665 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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HIF1AQ16665 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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HIF1AQ16665 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIF1AQ16665 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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