Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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EXT1Q16394 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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EXT1Q16394 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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EXT1Q16394 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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EXT1Q16394 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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EXT1Q16394 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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EXT1Q16394 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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EXT1Q16394 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXT1Q16394 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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EXT1Q16394 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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