Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms