Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM106CQ9BVX2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM106CQ9BVX2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms