Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE3

INPP4A, Type I inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INPP4AQ96PE3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
INPP4AQ96PE3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms