Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2E1P29083 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms