Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V0

LINC00271, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00271, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00271P0C7V0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00271P0C7V0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00271P0C7V0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00271P0C7V0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00271P0C7V0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00271P0C7V0 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00271P0C7V0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00271P0C7V0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00271P0C7V0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00271P0C7V0 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00271P0C7V0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00271P0C7V0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00271P0C7V0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00271P0C7V0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00271P0C7V0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00271P0C7V0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00271P0C7V0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00271P0C7V0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00271P0C7V0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00271P0C7V0 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00271P0C7V0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00271P0C7V0 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00271P0C7V0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00271P0C7V0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00271P0C7V0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00271P0C7V0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00271P0C7V0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00271P0C7V0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00271P0C7V0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00271P0C7V0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00271P0C7V0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00271P0C7V0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00271P0C7V0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00271P0C7V0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00271P0C7V0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00271P0C7V0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00271P0C7V0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00271P0C7V0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00271P0C7V0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00271P0C7V0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00271P0C7V0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00271P0C7V0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00271P0C7V0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00271P0C7V0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00271P0C7V0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00271P0C7V0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00271P0C7V0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00271P0C7V0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00271P0C7V0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00271P0C7V0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00271P0C7V0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00271P0C7V0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
LINC00271P0C7V0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LINC00271P0C7V0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LINC00271P0C7V0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LINC00271P0C7V0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LINC00271P0C7V0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00271P0C7V0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00271P0C7V0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00271P0C7V0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00271P0C7V0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00271P0C7V0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00271P0C7V0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00271P0C7V0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00271P0C7V0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00271P0C7V0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00271P0C7V0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00271P0C7V0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00271P0C7V0 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00271P0C7V0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00271P0C7V0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00271P0C7V0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00271P0C7V0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00271P0C7V0 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00271P0C7V0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00271P0C7V0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00271P0C7V0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00271P0C7V0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00271P0C7V0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00271P0C7V0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00271P0C7V0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00271P0C7V0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00271P0C7V0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00271P0C7V0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00271P0C7V0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00271P0C7V0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00271P0C7V0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00271P0C7V0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00271P0C7V0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00271P0C7V0 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00271P0C7V0 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00271P0C7V0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00271P0C7V0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00271P0C7V0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00271P0C7V0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00271P0C7V0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00271P0C7V0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00271P0C7V0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00271P0C7V0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00271P0C7V0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms