Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PHKA1P46020 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PHKA1P46020 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms