Protein–RNA interactions for Protein: Q12427

STB3, Protein STB3, yeastyeast

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
STB3Q12427 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt1.65□□□□□ -2.15
STB3Q12427 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt1.65□□□□□ -2.15
STB3Q12427 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt1.65□□□□□ -2.15
STB3Q12427 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt1.65□□□□□ -2.15
STB3Q12427 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt1.65□□□□□ -2.15
STB3Q12427 RPL41AYDL184C 78 nt1.64□□□□□ -2.15
STB3Q12427 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt1.64□□□□□ -2.15
STB3Q12427 CDC39YCR093W 6327 nt1.62□□□□□ -2.15
STB3Q12427 YML054C-AYML054C-A 159 nt1.61□□□□□ -2.15
STB3Q12427 DOP1YDR141C 5097 nt1.61□□□□□ -2.15
STB3Q12427 snR38snR38 95 nt1.6□□□□□ -2.15
STB3Q12427 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt1.6□□□□□ -2.15
STB3Q12427 AI1Q0050 2505 nt1.59□□□□□ -2.15
STB3Q12427 YER078W-AYER078W-A 165 nt1.59□□□□□ -2.15
STB3Q12427 IRA1YBR140C 9279 nt1.59□□□□□ -2.16
STB3Q12427 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt1.58□□□□□ -2.16
STB3Q12427 CAT8YMR280C 4302 nt1.57□□□□□ -2.16
STB3Q12427 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt1.56□□□□□ -2.16
STB3Q12427 snR75snR75 89 nt1.55□□□□□ -2.16
STB3Q12427 SKI7YOR076C 2244 nt1.54□□□□□ -2.16
STB3Q12427 NIP1YMR309C 2439 nt1.54□□□□□ -2.16
STB3Q12427 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.53□□□□□ -2.16
STB3Q12427 LAA1YJL207C 6045 nt1.53□□□□□ -2.16
STB3Q12427 SIP4YJL089W 2490 nt1.52□□□□□ -2.17
STB3Q12427 CCH1YGR217W 6120 nt1.52□□□□□ -2.17
STB3Q12427 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt1.52□□□□□ -2.17
STB3Q12427 BUL2YML111W 2763 nt1.52□□□□□ -2.17
STB3Q12427 SPC110YDR356W 2835 nt1.5□□□□□ -2.17
STB3Q12427 YOL014WYOL014W 375 nt1.49□□□□□ -2.17
STB3Q12427 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt1.45□□□□□ -2.18
STB3Q12427 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt1.43□□□□□ -2.18
STB3Q12427 HKR1YDR420W 5409 nt1.41□□□□□ -2.18
STB3Q12427 SPT7YBR081C 3999 nt1.39□□□□□ -2.19
STB3Q12427 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.39□□□□□ -2.19
STB3Q12427 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.39□□□□□ -2.19
STB3Q12427 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.39□□□□□ -2.19
STB3Q12427 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.39□□□□□ -2.19
STB3Q12427 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.39□□□□□ -2.19
STB3Q12427 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.39□□□□□ -2.19
STB3Q12427 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.39□□□□□ -2.19
STB3Q12427 IML1YJR138W 4755 nt1.38□□□□□ -2.19
STB3Q12427 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.37□□□□□ -2.19
STB3Q12427 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.37□□□□□ -2.19
STB3Q12427 YER090C-AYER090C-A 90 nt1.35□□□□□ -2.19
STB3Q12427 BUD3YCL014W 4911 nt1.34□□□□□ -2.19
STB3Q12427 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt1.32□□□□□ -2.2
STB3Q12427 SCC2YDR180W 4482 nt1.3□□□□□ -2.2
STB3Q12427 UTP20YBL004W 7482 nt1.28□□□□□ -2.2
STB3Q12427 YPR117WYPR117W 7470 nt1.23□□□□□ -2.21
STB3Q12427 LTE1YAL024C 4308 nt1.23□□□□□ -2.21
STB3Q12427 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt1.22□□□□□ -2.21
STB3Q12427 PET111YMR257C 2403 nt1.21□□□□□ -2.22
STB3Q12427 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt1.2□□□□□ -2.22
STB3Q12427 BEM2YER155C 6504 nt1.2□□□□□ -2.22
STB3Q12427 VAM6YDL077C 3150 nt1.19□□□□□ -2.22
STB3Q12427 RKR1YMR247C 4689 nt1.19□□□□□ -2.22
STB3Q12427 MLP2YIL149C 5040 nt1.17□□□□□ -2.22
STB3Q12427 snR67snR67 82 nt1.17□□□□□ -2.22
STB3Q12427 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.04□□□□□ -2.24
STB3Q12427 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.04□□□□□ -2.24
STB3Q12427 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.04□□□□□ -2.24
STB3Q12427 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.04□□□□□ -2.24
STB3Q12427 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.04□□□□□ -2.24
STB3Q12427 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt1.03□□□□□ -2.24
STB3Q12427 YMR160WYMR160W 2451 nt1.03□□□□□ -2.24
STB3Q12427 YJR029WYJR029W 5268 nt1.03□□□□□ -2.24
STB3Q12427 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.03□□□□□ -2.24
STB3Q12427 MYO1YHR023W 5787 nt1.03□□□□□ -2.25
STB3Q12427 MLP1YKR095W 5628 nt1.02□□□□□ -2.25
STB3Q12427 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt1□□□□□ -2.25
STB3Q12427 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt1□□□□□ -2.25
STB3Q12427 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt0.95□□□□□ -2.26
STB3Q12427 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.9□□□□□ -2.27
STB3Q12427 IQG1YPL242C 4488 nt0.88□□□□□ -2.27
STB3Q12427 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt0.86□□□□□ -2.27
STB3Q12427 YML100W-AYML100W-A 174 nt0.8□□□□□ -2.28
STB3Q12427 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.79□□□□□ -2.28
STB3Q12427 THO2YNL139C 4794 nt0.74□□□□□ -2.29
STB3Q12427 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt0.71□□□□□ -2.3
STB3Q12427 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.7□□□□□ -2.3
STB3Q12427 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.7□□□□□ -2.3
STB3Q12427 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.7□□□□□ -2.3
STB3Q12427 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.7□□□□□ -2.3
STB3Q12427 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.7□□□□□ -2.3
STB3Q12427 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.7□□□□□ -2.3
STB3Q12427 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.7□□□□□ -2.3
STB3Q12427 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.7□□□□□ -2.3
STB3Q12427 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.7□□□□□ -2.3
STB3Q12427 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.7□□□□□ -2.3
STB3Q12427 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.7□□□□□ -2.3
STB3Q12427 UTP10YJL109C 5310 nt0.68□□□□□ -2.3
STB3Q12427 ESP1YGR098C 4893 nt0.66□□□□□ -2.3
STB3Q12427 snR77snR77 88 nt0.65□□□□□ -2.31
STB3Q12427 snR40snR40 97 nt0.65□□□□□ -2.31
STB3Q12427 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.62□□□□□ -2.31
STB3Q12427 SOV1YMR066W 2697 nt0.62□□□□□ -2.31
STB3Q12427 SBH2YER019C-A 267 nt0.6□□□□□ -2.31
STB3Q12427 FMP27YLR454W 7887 nt0.59□□□□□ -2.31
STB3Q12427 snR128snR128 126 nt0.46□□□□□ -2.34
STB3Q12427 PAU9YBL108C-A 129 nt0.45□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 39.8 ms