Protein–RNA interactions for Protein: Q12211

PUS1, tRNA pseudouridine synthase 1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 544 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUS1Q12211 IRA1YBR140C 9279 nt1.73□□□□□ -2.13
PUS1Q12211 HKR1YDR420W 5409 nt1.73□□□□□ -2.13
PUS1Q12211 YSP1YHR155W 3687 nt1.72□□□□□ -2.13
PUS1Q12211 YLR422WYLR422W 5799 nt1.72□□□□□ -2.13
PUS1Q12211 HUG1YML058W-A 207 nt1.71□□□□□ -2.14
PUS1Q12211 CAT8YMR280C 4302 nt1.71□□□□□ -2.14
PUS1Q12211 MSN5YDR335W 3675 nt1.7□□□□□ -2.14
PUS1Q12211 BST1YFL025C 3090 nt1.7□□□□□ -2.14
PUS1Q12211 BRR2YER172C 6492 nt1.68□□□□□ -2.14
PUS1Q12211 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt1.67□□□□□ -2.14
PUS1Q12211 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt1.67□□□□□ -2.14
PUS1Q12211 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt1.66□□□□□ -2.14
PUS1Q12211 FYV8YGR196C 2454 nt1.66□□□□□ -2.14
PUS1Q12211 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.65□□□□□ -2.15
PUS1Q12211 CCH1YGR217W 6120 nt1.64□□□□□ -2.15
PUS1Q12211 PMD1YER132C 5262 nt1.64□□□□□ -2.15
PUS1Q12211 YER090C-AYER090C-A 90 nt1.63□□□□□ -2.15
PUS1Q12211 APL3YBL037W 3078 nt1.63□□□□□ -2.15
PUS1Q12211 SSK2YNR031C 4740 nt1.58□□□□□ -2.16
PUS1Q12211 CDC39YCR093W 6327 nt1.56□□□□□ -2.16
PUS1Q12211 YMR160WYMR160W 2451 nt1.56□□□□□ -2.16
PUS1Q12211 LAA1YJL207C 6045 nt1.56□□□□□ -2.16
PUS1Q12211 CLU1YMR012W 3834 nt1.54□□□□□ -2.16
PUS1Q12211 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt1.54□□□□□ -2.16
PUS1Q12211 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt1.54□□□□□ -2.16
PUS1Q12211 SWI4YER111C 3282 nt1.53□□□□□ -2.16
PUS1Q12211 NUP188YML103C 4968 nt1.52□□□□□ -2.17
PUS1Q12211 YGR130CYGR130C 2451 nt1.5□□□□□ -2.17
PUS1Q12211 CDC25YLR310C 4770 nt1.49□□□□□ -2.17
PUS1Q12211 snR67snR67 82 nt1.48□□□□□ -2.17
PUS1Q12211 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.46□□□□□ -2.18
PUS1Q12211 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.46□□□□□ -2.18
PUS1Q12211 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.46□□□□□ -2.18
PUS1Q12211 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.46□□□□□ -2.18
PUS1Q12211 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.46□□□□□ -2.18
PUS1Q12211 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.46□□□□□ -2.18
PUS1Q12211 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.46□□□□□ -2.18
PUS1Q12211 BUD3YCL014W 4911 nt1.45□□□□□ -2.18
PUS1Q12211 NUP145YGL092W 3954 nt1.43□□□□□ -2.18
PUS1Q12211 IML1YJR138W 4755 nt1.43□□□□□ -2.18
PUS1Q12211 SOV1YMR066W 2697 nt1.38□□□□□ -2.19
PUS1Q12211 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.38□□□□□ -2.19
PUS1Q12211 VAM6YDL077C 3150 nt1.36□□□□□ -2.19
PUS1Q12211 YPR117WYPR117W 7470 nt1.34□□□□□ -2.2
PUS1Q12211 snR77snR77 88 nt1.32□□□□□ -2.2
PUS1Q12211 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.31□□□□□ -2.2
PUS1Q12211 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.31□□□□□ -2.2
PUS1Q12211 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt1.31□□□□□ -2.2
PUS1Q12211 SPT7YBR081C 3999 nt1.3□□□□□ -2.2
PUS1Q12211 MLP2YIL149C 5040 nt1.27□□□□□ -2.21
PUS1Q12211 RKR1YMR247C 4689 nt1.24□□□□□ -2.21
PUS1Q12211 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.23□□□□□ -2.21
PUS1Q12211 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.23□□□□□ -2.21
PUS1Q12211 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.23□□□□□ -2.21
PUS1Q12211 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.23□□□□□ -2.21
PUS1Q12211 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.23□□□□□ -2.21
PUS1Q12211 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt1.23□□□□□ -2.21
PUS1Q12211 SCC2YDR180W 4482 nt1.18□□□□□ -2.22
PUS1Q12211 BEM2YER155C 6504 nt1.16□□□□□ -2.22
PUS1Q12211 SBH2YER019C-A 267 nt1.13□□□□□ -2.23
PUS1Q12211 DOP1YDR141C 5097 nt1.11□□□□□ -2.23
PUS1Q12211 PAU24YBR301W 363 nt1.11□□□□□ -2.23
PUS1Q12211 UTP20YBL004W 7482 nt1.11□□□□□ -2.23
PUS1Q12211 THO2YNL139C 4794 nt1.09□□□□□ -2.23
PUS1Q12211 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt1.09□□□□□ -2.23
PUS1Q12211 YML100W-AYML100W-A 174 nt1.02□□□□□ -2.25
PUS1Q12211 YJR029WYJR029W 5268 nt1.02□□□□□ -2.25
PUS1Q12211 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.02□□□□□ -2.25
PUS1Q12211 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.99□□□□□ -2.25
PUS1Q12211 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.99□□□□□ -2.25
PUS1Q12211 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.99□□□□□ -2.25
PUS1Q12211 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.99□□□□□ -2.25
PUS1Q12211 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.99□□□□□ -2.25
PUS1Q12211 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.99□□□□□ -2.25
PUS1Q12211 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.99□□□□□ -2.25
PUS1Q12211 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.99□□□□□ -2.25
PUS1Q12211 LTE1YAL024C 4308 nt0.91□□□□□ -2.26
PUS1Q12211 ESP1YGR098C 4893 nt0.89□□□□□ -2.27
PUS1Q12211 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt0.89□□□□□ -2.27
PUS1Q12211 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt0.82□□□□□ -2.28
PUS1Q12211 IQG1YPL242C 4488 nt0.81□□□□□ -2.28
PUS1Q12211 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.81□□□□□ -2.28
PUS1Q12211 snR6snR6 112 nt0.8□□□□□ -2.28
PUS1Q12211 YOL014WYOL014W 375 nt0.79□□□□□ -2.28
PUS1Q12211 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.77□□□□□ -2.29
PUS1Q12211 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.76□□□□□ -2.29
PUS1Q12211 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.76□□□□□ -2.29
PUS1Q12211 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.76□□□□□ -2.29
PUS1Q12211 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.76□□□□□ -2.29
PUS1Q12211 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.76□□□□□ -2.29
PUS1Q12211 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.76□□□□□ -2.29
PUS1Q12211 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.76□□□□□ -2.29
PUS1Q12211 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.76□□□□□ -2.29
PUS1Q12211 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.76□□□□□ -2.29
PUS1Q12211 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.76□□□□□ -2.29
PUS1Q12211 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.76□□□□□ -2.29
PUS1Q12211 RPL41BYDL133C-A 78 nt0.75□□□□□ -2.29
PUS1Q12211 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.75□□□□□ -2.29
PUS1Q12211 FMP27YLR454W 7887 nt0.73□□□□□ -2.29
PUS1Q12211 YJL113WYJL113W 4647 nt0.69□□□□□ -2.3
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