Protein–RNA interactions for Protein: Q06410

ATG17, Autophagy-related protein 17, yeastyeast

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG17Q06410 snR69snR69 101 nt-0.75□□□□□ -2.53
ATG17Q06410 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt-0.75□□□□□ -2.53
ATG17Q06410 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt-0.76□□□□□ -2.53
ATG17Q06410 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.77□□□□□ -2.53
ATG17Q06410 snR65snR65 100 nt-0.78□□□□□ -2.53
ATG17Q06410 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt-0.8□□□□□ -2.54
ATG17Q06410 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt-0.8□□□□□ -2.54
ATG17Q06410 snR56snR56 88 nt-0.81□□□□□ -2.54
ATG17Q06410 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt-0.81□□□□□ -2.54
ATG17Q06410 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt-0.82□□□□□ -2.54
ATG17Q06410 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.83□□□□□ -2.54
ATG17Q06410 YOR302WYOR302W 78 nt-0.83□□□□□ -2.54
ATG17Q06410 snR39BsnR39B 96 nt-0.83□□□□□ -2.54
ATG17Q06410 YER090C-AYER090C-A 90 nt-0.84□□□□□ -2.54
ATG17Q06410 PMP2YEL017C-A 132 nt-0.85□□□□□ -2.55
ATG17Q06410 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt-0.85□□□□□ -2.55
ATG17Q06410 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.87□□□□□ -2.55
ATG17Q06410 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.87□□□□□ -2.55
ATG17Q06410 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.87□□□□□ -2.55
ATG17Q06410 RDS3YPR094W 324 nt-0.87□□□□□ -2.55
ATG17Q06410 YNL266WYNL266W 420 nt-0.88□□□□□ -2.55
ATG17Q06410 snR50snR50 90 nt-0.88□□□□□ -2.55
ATG17Q06410 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.9□□□□□ -2.55
ATG17Q06410 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt-0.96□□□□□ -2.56
ATG17Q06410 JLP2YMR132C 627 nt-0.96□□□□□ -2.56
ATG17Q06410 snR33snR33 183 nt-0.96□□□□□ -2.56
ATG17Q06410 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt-1□□□□□ -2.57
ATG17Q06410 snR48snR48 113 nt-1□□□□□ -2.57
ATG17Q06410 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-1.01□□□□□ -2.57
ATG17Q06410 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt-1.03□□□□□ -2.57
ATG17Q06410 snR161snR161 161 nt-1.04□□□□□ -2.58
ATG17Q06410 snR52snR52 92 nt-1.04□□□□□ -2.58
ATG17Q06410 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-1.06□□□□□ -2.58
ATG17Q06410 YNL205CYNL205C 423 nt-1.06□□□□□ -2.58
ATG17Q06410 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt-1.07□□□□□ -2.58
ATG17Q06410 snR80snR80 171 nt-1.08□□□□□ -2.58
ATG17Q06410 YBR178WYBR178W 375 nt-1.08□□□□□ -2.58
ATG17Q06410 snR67snR67 82 nt-1.09□□□□□ -2.58
ATG17Q06410 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt-1.09□□□□□ -2.58
ATG17Q06410 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-1.13□□□□□ -2.59
ATG17Q06410 SKI7YOR076C 2244 nt-1.15□□□□□ -2.59
ATG17Q06410 YOR102WYOR102W 351 nt-1.16□□□□□ -2.6
ATG17Q06410 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt-1.21□□□□□ -2.6
ATG17Q06410 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.23□□□□□ -2.61
ATG17Q06410 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-1.3□□□□□ -2.62
ATG17Q06410 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-1.33□□□□□ -2.62
ATG17Q06410 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt-1.35□□□□□ -2.63
ATG17Q06410 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-1.36□□□□□ -2.63
ATG17Q06410 YNL198CYNL198C 303 nt-1.36□□□□□ -2.63
ATG17Q06410 YML054C-AYML054C-A 159 nt-1.39□□□□□ -2.63
ATG17Q06410 YJL150WYJL150W 303 nt-1.44□□□□□ -2.64
ATG17Q06410 YBL053WYBL053W 375 nt-1.46□□□□□ -2.64
ATG17Q06410 SOM1YEL059C-A 225 nt-1.53□□□□□ -2.65
ATG17Q06410 YNR077CYNR077C 255 nt-1.56□□□□□ -2.66
ATG17Q06410 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-1.58□□□□□ -2.66
ATG17Q06410 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-1.59□□□□□ -2.66
ATG17Q06410 snR77snR77 88 nt-1.61□□□□□ -2.67
ATG17Q06410 Q0142Q0142 177 nt-1.61□□□□□ -2.67
ATG17Q06410 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt-1.62□□□□□ -2.67
ATG17Q06410 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-1.62□□□□□ -2.67
ATG17Q06410 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt-1.62□□□□□ -2.67
ATG17Q06410 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-1.62□□□□□ -2.67
ATG17Q06410 SPG3YDR504C 384 nt-1.71□□□□□ -2.68
ATG17Q06410 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-1.81□□□□□ -2.7
ATG17Q06410 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.82□□□□□ -2.7
ATG17Q06410 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-1.82□□□□□ -2.7
ATG17Q06410 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-1.83□□□□□ -2.7
ATG17Q06410 snR81snR81 201 nt-1.84□□□□□ -2.7
ATG17Q06410 YGR151CYGR151C 336 nt-1.85□□□□□ -2.71
ATG17Q06410 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-1.85□□□□□ -2.71
ATG17Q06410 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt-1.87□□□□□ -2.71
ATG17Q06410 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-1.87□□□□□ -2.71
ATG17Q06410 RPL41AYDL184C 78 nt-1.89□□□□□ -2.71
ATG17Q06410 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-1.9□□□□□ -2.71
ATG17Q06410 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-1.91□□□□□ -2.72
ATG17Q06410 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt-1.94□□□□□ -2.72
ATG17Q06410 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt-1.95□□□□□ -2.72
ATG17Q06410 snR38snR38 95 nt-1.97□□□□□ -2.72
ATG17Q06410 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-1.99□□□□□ -2.73
ATG17Q06410 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-2.06□□□□□ -2.74
ATG17Q06410 YNL338WYNL338W 159 nt-2.06□□□□□ -2.74
ATG17Q06410 snR47snR47 99 nt-2.11□□□□□ -2.75
ATG17Q06410 YOR309CYOR309C 381 nt-2.19□□□□□ -2.76
ATG17Q06410 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-2.2□□□□□ -2.76
ATG17Q06410 YNL337WYNL337W 255 nt-2.24□□□□□ -2.77
ATG17Q06410 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-2.3□□□□□ -2.78
ATG17Q06410 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-2.36□□□□□ -2.79
ATG17Q06410 snR6snR6 112 nt-2.37□□□□□ -2.79
ATG17Q06410 YKL225WYKL225W 348 nt-2.38□□□□□ -2.79
ATG17Q06410 Q0032Q0032 291 nt-2.45□□□□□ -2.8
ATG17Q06410 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-2.5□□□□□ -2.81
ATG17Q06410 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt-2.53□□□□□ -2.81
ATG17Q06410 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt-2.53□□□□□ -2.81
ATG17Q06410 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-2.55□□□□□ -2.82
ATG17Q06410 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-2.55□□□□□ -2.82
ATG17Q06410 snR73snR73 106 nt-2.58□□□□□ -2.82
ATG17Q06410 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt-2.58□□□□□ -2.82
ATG17Q06410 RPL41BYDL133C-A 78 nt-2.6□□□□□ -2.83
ATG17Q06410 snR61snR61 90 nt-2.61□□□□□ -2.83
ATG17Q06410 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-2.63□□□□□ -2.83
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 65 ms