Protein–RNA interactions for Protein: Q06139

YLR346C, Uncharacterized protein YLR346C, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR346CQ06139 YOR093CYOR093C 4947 nt1.68□□□□□ -2.14
YLR346CQ06139 NUP145YGL092W 3954 nt1.67□□□□□ -2.14
YLR346CQ06139 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt1.66□□□□□ -2.14
YLR346CQ06139 YER090C-AYER090C-A 90 nt1.63□□□□□ -2.15
YLR346CQ06139 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt1.63□□□□□ -2.15
YLR346CQ06139 CFT1YDR301W 4074 nt1.62□□□□□ -2.15
YLR346CQ06139 DNF3YMR162C 4971 nt1.62□□□□□ -2.15
YLR346CQ06139 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.62□□□□□ -2.15
YLR346CQ06139 SSK2YNR031C 4740 nt1.62□□□□□ -2.15
YLR346CQ06139 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt1.59□□□□□ -2.15
YLR346CQ06139 FYV8YGR196C 2454 nt1.59□□□□□ -2.16
YLR346CQ06139 VPS15YBR097W 4365 nt1.58□□□□□ -2.16
YLR346CQ06139 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt1.58□□□□□ -2.16
YLR346CQ06139 CLU1YMR012W 3834 nt1.58□□□□□ -2.16
YLR346CQ06139 BST1YFL025C 3090 nt1.52□□□□□ -2.17
YLR346CQ06139 BUD3YCL014W 4911 nt1.51□□□□□ -2.17
YLR346CQ06139 YGR130CYGR130C 2451 nt1.5□□□□□ -2.17
YLR346CQ06139 MEC1YBR136W 7107 nt1.49□□□□□ -2.17
YLR346CQ06139 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.49□□□□□ -2.17
YLR346CQ06139 TMA7YLR262C-A 195 nt1.48□□□□□ -2.17
YLR346CQ06139 snR40snR40 97 nt1.48□□□□□ -2.17
YLR346CQ06139 snR67snR67 82 nt1.47□□□□□ -2.17
YLR346CQ06139 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.47□□□□□ -2.17
YLR346CQ06139 IRA1YBR140C 9279 nt1.47□□□□□ -2.17
YLR346CQ06139 CCH1YGR217W 6120 nt1.46□□□□□ -2.18
YLR346CQ06139 SPT7YBR081C 3999 nt1.45□□□□□ -2.18
YLR346CQ06139 CAT8YMR280C 4302 nt1.43□□□□□ -2.18
YLR346CQ06139 BRR2YER172C 6492 nt1.43□□□□□ -2.18
YLR346CQ06139 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt1.42□□□□□ -2.18
YLR346CQ06139 VAM6YDL077C 3150 nt1.41□□□□□ -2.18
YLR346CQ06139 YPR117WYPR117W 7470 nt1.39□□□□□ -2.19
YLR346CQ06139 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt1.38□□□□□ -2.19
YLR346CQ06139 RKR1YMR247C 4689 nt1.37□□□□□ -2.19
YLR346CQ06139 YMR160WYMR160W 2451 nt1.36□□□□□ -2.19
YLR346CQ06139 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.36□□□□□ -2.19
YLR346CQ06139 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.33□□□□□ -2.2
YLR346CQ06139 FIG2YCR089W 4830 nt1.28□□□□□ -2.2
YLR346CQ06139 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt1.19□□□□□ -2.22
YLR346CQ06139 MLP2YIL149C 5040 nt1.18□□□□□ -2.22
YLR346CQ06139 HKR1YDR420W 5409 nt1.17□□□□□ -2.22
YLR346CQ06139 snR77snR77 88 nt1.15□□□□□ -2.23
YLR346CQ06139 SOV1YMR066W 2697 nt1.15□□□□□ -2.23
YLR346CQ06139 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.13□□□□□ -2.23
YLR346CQ06139 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.13□□□□□ -2.23
YLR346CQ06139 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.13□□□□□ -2.23
YLR346CQ06139 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.13□□□□□ -2.23
YLR346CQ06139 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.13□□□□□ -2.23
YLR346CQ06139 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.13□□□□□ -2.23
YLR346CQ06139 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.13□□□□□ -2.23
YLR346CQ06139 PAU24YBR301W 363 nt1.11□□□□□ -2.23
YLR346CQ06139 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt1.09□□□□□ -2.23
YLR346CQ06139 SCC2YDR180W 4482 nt1.03□□□□□ -2.24
YLR346CQ06139 YML100W-AYML100W-A 174 nt1.03□□□□□ -2.24
YLR346CQ06139 LTE1YAL024C 4308 nt1.02□□□□□ -2.25
YLR346CQ06139 YJR029WYJR029W 5268 nt1□□□□□ -2.25
YLR346CQ06139 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1□□□□□ -2.25
YLR346CQ06139 SBH2YER019C-A 267 nt0.99□□□□□ -2.25
YLR346CQ06139 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt0.99□□□□□ -2.25
YLR346CQ06139 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt0.99□□□□□ -2.25
YLR346CQ06139 DOP1YDR141C 5097 nt0.98□□□□□ -2.25
YLR346CQ06139 THO2YNL139C 4794 nt0.97□□□□□ -2.25
YLR346CQ06139 IML1YJR138W 4755 nt0.89□□□□□ -2.27
YLR346CQ06139 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.86□□□□□ -2.27
YLR346CQ06139 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.86□□□□□ -2.27
YLR346CQ06139 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.86□□□□□ -2.27
YLR346CQ06139 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.86□□□□□ -2.27
YLR346CQ06139 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.86□□□□□ -2.27
YLR346CQ06139 BEM2YER155C 6504 nt0.85□□□□□ -2.27
YLR346CQ06139 IQG1YPL242C 4488 nt0.83□□□□□ -2.28
YLR346CQ06139 ESP1YGR098C 4893 nt0.82□□□□□ -2.28
YLR346CQ06139 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.76□□□□□ -2.29
YLR346CQ06139 MLP1YKR095W 5628 nt0.76□□□□□ -2.29
YLR346CQ06139 FMP27YLR454W 7887 nt0.68□□□□□ -2.3
YLR346CQ06139 YJL113WYJL113W 4647 nt0.63□□□□□ -2.31
YLR346CQ06139 UTP10YJL109C 5310 nt0.62□□□□□ -2.31
YLR346CQ06139 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.62□□□□□ -2.31
YLR346CQ06139 PAU9YBL108C-A 129 nt0.6□□□□□ -2.31
YLR346CQ06139 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.58□□□□□ -2.32
YLR346CQ06139 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.58□□□□□ -2.32
YLR346CQ06139 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.58□□□□□ -2.32
YLR346CQ06139 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.58□□□□□ -2.32
YLR346CQ06139 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.58□□□□□ -2.32
YLR346CQ06139 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.58□□□□□ -2.32
YLR346CQ06139 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.58□□□□□ -2.32
YLR346CQ06139 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.58□□□□□ -2.32
YLR346CQ06139 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.58□□□□□ -2.32
YLR346CQ06139 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.58□□□□□ -2.32
YLR346CQ06139 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.58□□□□□ -2.32
YLR346CQ06139 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt0.58□□□□□ -2.32
YLR346CQ06139 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.55□□□□□ -2.32
YLR346CQ06139 snR6snR6 112 nt0.54□□□□□ -2.32
YLR346CQ06139 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.51□□□□□ -2.33
YLR346CQ06139 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt0.49□□□□□ -2.33
YLR346CQ06139 snR128snR128 126 nt0.49□□□□□ -2.33
YLR346CQ06139 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt0.45□□□□□ -2.34
YLR346CQ06139 snR161snR161 161 nt0.41□□□□□ -2.34
YLR346CQ06139 RPL41BYDL133C-A 78 nt0.39□□□□□ -2.35
YLR346CQ06139 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.39□□□□□ -2.35
YLR346CQ06139 UTP20YBL004W 7482 nt0.39□□□□□ -2.35
YLR346CQ06139 snR73snR73 106 nt0.35□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.3 ms