Protein–RNA interactions for Protein: Q02983

RRN5, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN5, yeast

Predictions only

Length 363 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRN5	Q02983	YPR012W	YPR012W	255 nt		-0.98	□□□□□ -2.57
RRN5	Q02983	YEL014C	YEL014C	306 nt		-0.99	□□□□□ -2.57
RRN5	Q02983	YER181C	YER181C	324 nt		-0.99	□□□□□ -2.57
RRN5	Q02983	YNL277W-A	YNL277W-A	189 nt		-0.99	□□□□□ -2.57
RRN5	Q02983	tP(UGG)Q	tP(UGG)Q	72 nt		-1	□□□□□ -2.57
RRN5	Q02983	YER090C-A	YER090C-A	90 nt		-1.01	□□□□□ -2.57
RRN5	Q02983	snR50	snR50	90 nt		-1.01	□□□□□ -2.57
RRN5	Q02983	GIM4	YEL003W	336 nt		-1.02	□□□□□ -2.57
RRN5	Q02983	YNL266W	YNL266W	420 nt		-1.03	□□□□□ -2.57
RRN5	Q02983	RDS3	YPR094W	324 nt		-1.03	□□□□□ -2.57
RRN5	Q02983	YGR146C-A	YGR146C-A	162 nt		-1.04	□□□□□ -2.58
RRN5	Q02983	YBR131C-A	YBR131C-A	90 nt		-1.05	□□□□□ -2.58
RRN5	Q02983	snR39B	snR39B	96 nt		-1.05	□□□□□ -2.58
RRN5	Q02983	PMP2	YEL017C-A	132 nt		-1.06	□□□□□ -2.58
RRN5	Q02983	JLP2	YMR132C	627 nt		-1.06	□□□□□ -2.58
RRN5	Q02983	snR55	snR55	98 nt		-1.09	□□□□□ -2.58
RRN5	Q02983	YFL019C	YFL019C	354 nt		-1.09	□□□□□ -2.58
RRN5	Q02983	Q0144	Q0144	330 nt		-1.1	□□□□□ -2.59
RRN5	Q02983	YBR223W-A	YBR223W-A	120 nt		-1.12	□□□□□ -2.59
RRN5	Q02983	YOR329W-A	YOR329W-A	210 nt		-1.15	□□□□□ -2.59
RRN5	Q02983	YNL097C-B	YNL097C-B	123 nt		-1.16	□□□□□ -2.6
RRN5	Q02983	SKI7	YOR076C	2244 nt		-1.18	□□□□□ -2.6
RRN5	Q02983	snR67	snR67	82 nt		-1.2	□□□□□ -2.6
RRN5	Q02983	tD(GUC)Q	tD(GUC)Q	75 nt		-1.21	□□□□□ -2.6
RRN5	Q02983	YOL155W-A	YOL155W-A	135 nt		-1.23	□□□□□ -2.61
RRN5	Q02983	YLR286W-A	YLR286W-A	135 nt		-1.25	□□□□□ -2.61
RRN5	Q02983	snR65	snR65	100 nt		-1.29	□□□□□ -2.62
RRN5	Q02983	YNL205C	YNL205C	423 nt		-1.29	□□□□□ -2.62
RRN5	Q02983	YPL152W-A	YPL152W-A	99 nt		-1.29	□□□□□ -2.62
RRN5	Q02983	YBR178W	YBR178W	375 nt		-1.29	□□□□□ -2.62
RRN5	Q02983	YOR302W	YOR302W	78 nt		-1.31	□□□□□ -2.62
RRN5	Q02983	snR48	snR48	113 nt		-1.31	□□□□□ -2.62
RRN5	Q02983	YDL159C-B	YDL159C-B	177 nt		-1.33	□□□□□ -2.62
RRN5	Q02983	YML054C-A	YML054C-A	159 nt		-1.33	□□□□□ -2.62
RRN5	Q02983	tY(GUA)Q	tY(GUA)Q	84 nt		-1.34	□□□□□ -2.62
RRN5	Q02983	CDC65	tQ(CUG)M	72 nt		-1.35	□□□□□ -2.63
RRN5	Q02983	snR77	snR77	88 nt		-1.36	□□□□□ -2.63
RRN5	Q02983	YNR077C	YNR077C	255 nt		-1.38	□□□□□ -2.63
RRN5	Q02983	YOR102W	YOR102W	351 nt		-1.4	□□□□□ -2.63
RRN5	Q02983	tL(UAA)Q	tL(UAA)Q	85 nt		-1.41	□□□□□ -2.64
RRN5	Q02983	YHR175W-A	YHR175W-A	150 nt		-1.41	□□□□□ -2.64
RRN5	Q02983	YGL188C-A	YGL188C-A	141 nt		-1.42	□□□□□ -2.64
RRN5	Q02983	YGR240C-A	YGR240C-A	201 nt		-1.42	□□□□□ -2.64
RRN5	Q02983	YLR342W-A	YLR342W-A	174 nt		-1.44	□□□□□ -2.64
RRN5	Q02983	snR52	snR52	92 nt		-1.44	□□□□□ -2.64
RRN5	Q02983	snR81	snR81	201 nt		-1.45	□□□□□ -2.64
RRN5	Q02983	YMR315W-A	YMR315W-A	108 nt		-1.46	□□□□□ -2.64
RRN5	Q02983	YHL015W-A	YHL015W-A	84 nt		-1.49	□□□□□ -2.65
RRN5	Q02983	YLR299C-A	YLR299C-A	93 nt		-1.49	□□□□□ -2.65
RRN5	Q02983	tR(ACG)Q2	tR(ACG)Q2	74 nt		-1.52	□□□□□ -2.65
RRN5	Q02983	snR56	snR56	88 nt		-1.53	□□□□□ -2.65
RRN5	Q02983	YBR196C-A	YBR196C-A	150 nt		-1.53	□□□□□ -2.65
RRN5	Q02983	YOR376W-A	YOR376W-A	156 nt		-1.56	□□□□□ -2.66
RRN5	Q02983	YOR231C-A	YOR231C-A	201 nt		-1.58	□□□□□ -2.66
RRN5	Q02983	snR80	snR80	171 nt		-1.6	□□□□□ -2.67
RRN5	Q02983	YHR180C-B	YHR180C-B	105 nt		-1.71	□□□□□ -2.68
RRN5	Q02983	YOR309C	YOR309C	381 nt		-1.71	□□□□□ -2.68
RRN5	Q02983	YNL198C	YNL198C	303 nt		-1.72	□□□□□ -2.68
RRN5	Q02983	YDR524W-C	YDR524W-C	90 nt		-1.74	□□□□□ -2.69
RRN5	Q02983	YDR406W-A	YDR406W-A	246 nt		-1.76	□□□□□ -2.69
RRN5	Q02983	YOR316C-A	YOR316C-A	210 nt		-1.77	□□□□□ -2.69
RRN5	Q02983	YKL106C-A	YKL106C-A	120 nt		-1.79	□□□□□ -2.7
RRN5	Q02983	SOM1	YEL059C-A	225 nt		-1.83	□□□□□ -2.7
RRN5	Q02983	YJL150W	YJL150W	303 nt		-1.83	□□□□□ -2.7
RRN5	Q02983	YBL053W	YBL053W	375 nt		-1.9	□□□□□ -2.71
RRN5	Q02983	YBR126W-B	YBR126W-B	144 nt		-1.9	□□□□□ -2.71
RRN5	Q02983	YCR095W-A	YCR095W-A	159 nt		-1.93	□□□□□ -2.72
RRN5	Q02983	YBR109W-A	YBR109W-A	225 nt		-1.94	□□□□□ -2.72
RRN5	Q02983	RPL41A	YDL184C	78 nt		-1.99	□□□□□ -2.73
RRN5	Q02983	YBR296C-A	YBR296C-A	120 nt		-2	□□□□□ -2.73
RRN5	Q02983	snR38	snR38	95 nt		-2.05	□□□□□ -2.74
RRN5	Q02983	snR6	snR6	112 nt		-2.06	□□□□□ -2.74
RRN5	Q02983	YOL083C-A	YOL083C-A	141 nt		-2.1	□□□□□ -2.75
RRN5	Q02983	YMR046W-A	YMR046W-A	129 nt		-2.11	□□□□□ -2.75
RRN5	Q02983	YOR335W-A	YOR335W-A	81 nt		-2.14	□□□□□ -2.75
RRN5	Q02983	YGR151C	YGR151C	336 nt		-2.16	□□□□□ -2.76
RRN5	Q02983	YBL071C-B	YBL071C-B	99 nt		-2.16	□□□□□ -2.76
RRN5	Q02983	snR73	snR73	106 nt		-2.19	□□□□□ -2.76
RRN5	Q02983	YOL164W-A	YOL164W-A	183 nt		-2.2	□□□□□ -2.76
RRN5	Q02983	snR47	snR47	99 nt		-2.23	□□□□□ -2.77
RRN5	Q02983	RPL41B	YDL133C-A	78 nt		-2.24	□□□□□ -2.77
RRN5	Q02983	SPG3	YDR504C	384 nt		-2.26	□□□□□ -2.77
RRN5	Q02983	YAL037C-A	YAL037C-A	93 nt		-2.34	□□□□□ -2.78
RRN5	Q02983	YCL001W-B	YCL001W-B	255 nt		-2.34	□□□□□ -2.78
RRN5	Q02983	tM(CAU)Q1	tM(CAU)Q1	76 nt		-2.38	□□□□□ -2.79
RRN5	Q02983	YBL100W-C	YBL100W-C	120 nt		-2.39	□□□□□ -2.79
RRN5	Q02983	YDL114W-A	YDL114W-A	114 nt		-2.43	□□□□□ -2.8
RRN5	Q02983	tS(GCU)Q1	tS(GCU)Q1	86 nt		-2.44	□□□□□ -2.8
RRN5	Q02983	tV(UAC)Q	tV(UAC)Q	76 nt		-2.45	□□□□□ -2.8
RRN5	Q02983	YKL225W	YKL225W	348 nt		-2.46	□□□□□ -2.8
RRN5	Q02983	Q0142	Q0142	177 nt		-2.47	□□□□□ -2.8
RRN5	Q02983	YLR466C-B	YLR466C-B	117 nt		-2.47	□□□□□ -2.8
RRN5	Q02983	snR85	snR85	171 nt		-2.48	□□□□□ -2.81
RRN5	Q02983	YDR524C-A	YDR524C-A	120 nt		-2.51	□□□□□ -2.81
RRN5	Q02983	YNL338W	YNL338W	159 nt		-2.58	□□□□□ -2.82
RRN5	Q02983	YNL337W	YNL337W	255 nt		-2.59	□□□□□ -2.82
RRN5	Q02983	YDR543C	YDR543C	300 nt		-2.62	□□□□□ -2.83
RRN5	Q02983	YDL159W-A	YDL159W-A	132 nt		-2.7	□□□□□ -2.84
RRN5	Q02983	YGR122C-A	YGR122C-A	129 nt		-2.73	□□□□□ -2.85
RRN5	Q02983	YDR034C-A	YDR034C-A	177 nt		-2.77	□□□□□ -2.85

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