Protein–RNA interactions for Protein: P36164

TVP38, Golgi apparatus membrane protein TVP38, yeastyeast

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Length 337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TVP38P36164 snR69snR69 101 nt-0.55□□□□□ -2.5
TVP38P36164 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt-0.56□□□□□ -2.5
TVP38P36164 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt-0.56□□□□□ -2.5
TVP38P36164 URB1YKL014C 5295 nt-0.56□□□□□ -2.5
TVP38P36164 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.57□□□□□ -2.5
TVP38P36164 YOR170WYOR170W 306 nt-0.57□□□□□ -2.5
TVP38P36164 snR39BsnR39B 96 nt-0.57□□□□□ -2.5
TVP38P36164 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt-0.58□□□□□ -2.5
TVP38P36164 snR56snR56 88 nt-0.59□□□□□ -2.5
TVP38P36164 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt-0.59□□□□□ -2.5
TVP38P36164 snR65snR65 100 nt-0.6□□□□□ -2.51
TVP38P36164 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt-0.6□□□□□ -2.51
TVP38P36164 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt-0.6□□□□□ -2.51
TVP38P36164 snR50snR50 90 nt-0.61□□□□□ -2.51
TVP38P36164 YER090C-AYER090C-A 90 nt-0.62□□□□□ -2.51
TVP38P36164 YNL266WYNL266W 420 nt-0.62□□□□□ -2.51
TVP38P36164 PMP2YEL017C-A 132 nt-0.63□□□□□ -2.51
TVP38P36164 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt-0.63□□□□□ -2.51
TVP38P36164 JLP2YMR132C 627 nt-0.64□□□□□ -2.51
TVP38P36164 RDS3YPR094W 324 nt-0.66□□□□□ -2.52
TVP38P36164 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt-0.7□□□□□ -2.52
TVP38P36164 snR80snR80 171 nt-0.71□□□□□ -2.52
TVP38P36164 snR33snR33 183 nt-0.71□□□□□ -2.52
TVP38P36164 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt-0.72□□□□□ -2.52
TVP38P36164 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.72□□□□□ -2.52
TVP38P36164 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.72□□□□□ -2.52
TVP38P36164 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.72□□□□□ -2.52
TVP38P36164 snR52snR52 92 nt-0.73□□□□□ -2.53
TVP38P36164 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-0.74□□□□□ -2.53
TVP38P36164 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt-0.74□□□□□ -2.53
TVP38P36164 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt-0.75□□□□□ -2.53
TVP38P36164 snR48snR48 113 nt-0.75□□□□□ -2.53
TVP38P36164 YBR178WYBR178W 375 nt-0.77□□□□□ -2.53
TVP38P36164 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-0.78□□□□□ -2.53
TVP38P36164 SKI7YOR076C 2244 nt-0.81□□□□□ -2.54
TVP38P36164 YNL205CYNL205C 423 nt-0.81□□□□□ -2.54
TVP38P36164 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-0.83□□□□□ -2.54
TVP38P36164 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt-0.83□□□□□ -2.54
TVP38P36164 snR67snR67 82 nt-0.84□□□□□ -2.54
TVP38P36164 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.85□□□□□ -2.54
TVP38P36164 snR161snR161 161 nt-0.85□□□□□ -2.55
TVP38P36164 YOR102WYOR102W 351 nt-0.89□□□□□ -2.55
TVP38P36164 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt-0.91□□□□□ -2.56
TVP38P36164 YNL198CYNL198C 303 nt-0.95□□□□□ -2.56
TVP38P36164 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-0.97□□□□□ -2.56
TVP38P36164 YBL053WYBL053W 375 nt-0.97□□□□□ -2.56
TVP38P36164 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.98□□□□□ -2.57
TVP38P36164 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.98□□□□□ -2.57
TVP38P36164 YJL150WYJL150W 303 nt-1.01□□□□□ -2.57
TVP38P36164 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-1.01□□□□□ -2.57
TVP38P36164 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt-1.02□□□□□ -2.57
TVP38P36164 YML054C-AYML054C-A 159 nt-1.02□□□□□ -2.57
TVP38P36164 YNR077CYNR077C 255 nt-1.05□□□□□ -2.58
TVP38P36164 snR77snR77 88 nt-1.12□□□□□ -2.59
TVP38P36164 SOM1YEL059C-A 225 nt-1.15□□□□□ -2.59
TVP38P36164 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-1.15□□□□□ -2.59
TVP38P36164 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-1.16□□□□□ -2.6
TVP38P36164 Q0142Q0142 177 nt-1.17□□□□□ -2.6
TVP38P36164 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-1.18□□□□□ -2.6
TVP38P36164 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt-1.23□□□□□ -2.61
TVP38P36164 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt-1.23□□□□□ -2.61
TVP38P36164 SPG3YDR504C 384 nt-1.24□□□□□ -2.61
TVP38P36164 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-1.24□□□□□ -2.61
TVP38P36164 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-1.33□□□□□ -2.62
TVP38P36164 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-1.33□□□□□ -2.62
TVP38P36164 YGR151CYGR151C 336 nt-1.34□□□□□ -2.62
TVP38P36164 snR81snR81 201 nt-1.35□□□□□ -2.63
TVP38P36164 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-1.35□□□□□ -2.63
TVP38P36164 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.36□□□□□ -2.63
TVP38P36164 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-1.36□□□□□ -2.63
TVP38P36164 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-1.37□□□□□ -2.63
TVP38P36164 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-1.37□□□□□ -2.63
TVP38P36164 snR38snR38 95 nt-1.38□□□□□ -2.63
TVP38P36164 RPL41AYDL184C 78 nt-1.4□□□□□ -2.63
TVP38P36164 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt-1.4□□□□□ -2.63
TVP38P36164 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-1.41□□□□□ -2.64
TVP38P36164 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt-1.41□□□□□ -2.64
TVP38P36164 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-1.44□□□□□ -2.64
TVP38P36164 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt-1.45□□□□□ -2.64
TVP38P36164 YNL338WYNL338W 159 nt-1.47□□□□□ -2.64
TVP38P36164 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-1.53□□□□□ -2.65
TVP38P36164 snR47snR47 99 nt-1.53□□□□□ -2.65
TVP38P36164 YOR309CYOR309C 381 nt-1.56□□□□□ -2.66
TVP38P36164 YNL337WYNL337W 255 nt-1.66□□□□□ -2.68
TVP38P36164 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-1.67□□□□□ -2.68
TVP38P36164 snR6snR6 112 nt-1.69□□□□□ -2.68
TVP38P36164 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-1.69□□□□□ -2.68
TVP38P36164 YKL225WYKL225W 348 nt-1.74□□□□□ -2.69
TVP38P36164 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-1.8□□□□□ -2.7
TVP38P36164 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt-1.83□□□□□ -2.7
TVP38P36164 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-1.84□□□□□ -2.7
TVP38P36164 Q0032Q0032 291 nt-1.85□□□□□ -2.71
TVP38P36164 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt-1.85□□□□□ -2.71
TVP38P36164 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt-1.85□□□□□ -2.71
TVP38P36164 snR73snR73 106 nt-1.87□□□□□ -2.71
TVP38P36164 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-1.88□□□□□ -2.71
TVP38P36164 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-1.91□□□□□ -2.72
TVP38P36164 snR61snR61 90 nt-1.93□□□□□ -2.72
TVP38P36164 RPL41BYDL133C-A 78 nt-1.96□□□□□ -2.72
TVP38P36164 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-1.96□□□□□ -2.72
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