Protein–RNA interactions for Protein: O13536

YHR139C-A, Uncharacterized protein YHR139C-A, yeastyeast

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHR139C-AO13536 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt-0.57□□□□□ -2.5
YHR139C-AO13536 YNL266WYNL266W 420 nt-0.58□□□□□ -2.5
YHR139C-AO13536 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.58□□□□□ -2.5
YHR139C-AO13536 snR50snR50 90 nt-0.58□□□□□ -2.5
YHR139C-AO13536 snR55snR55 98 nt-0.6□□□□□ -2.51
YHR139C-AO13536 snR49snR49 165 nt-0.6□□□□□ -2.51
YHR139C-AO13536 YER090C-AYER090C-A 90 nt-0.61□□□□□ -2.51
YHR139C-AO13536 JLP2YMR132C 627 nt-0.61□□□□□ -2.51
YHR139C-AO13536 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt-0.61□□□□□ -2.51
YHR139C-AO13536 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt-0.61□□□□□ -2.51
YHR139C-AO13536 URB1YKL014C 5295 nt-0.62□□□□□ -2.51
YHR139C-AO13536 PMP2YEL017C-A 132 nt-0.63□□□□□ -2.51
YHR139C-AO13536 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt-0.63□□□□□ -2.51
YHR139C-AO13536 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt-0.64□□□□□ -2.51
YHR139C-AO13536 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt-0.65□□□□□ -2.51
YHR139C-AO13536 snR33snR33 183 nt-0.65□□□□□ -2.51
YHR139C-AO13536 snR65snR65 100 nt-0.66□□□□□ -2.52
YHR139C-AO13536 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt-0.66□□□□□ -2.52
YHR139C-AO13536 RDS3YPR094W 324 nt-0.66□□□□□ -2.52
YHR139C-AO13536 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt-0.67□□□□□ -2.52
YHR139C-AO13536 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.67□□□□□ -2.52
YHR139C-AO13536 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.67□□□□□ -2.52
YHR139C-AO13536 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.67□□□□□ -2.52
YHR139C-AO13536 snR56snR56 88 nt-0.72□□□□□ -2.52
YHR139C-AO13536 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt-0.72□□□□□ -2.52
YHR139C-AO13536 snR80snR80 171 nt-0.73□□□□□ -2.53
YHR139C-AO13536 SKI7YOR076C 2244 nt-0.73□□□□□ -2.53
YHR139C-AO13536 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-0.74□□□□□ -2.53
YHR139C-AO13536 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt-0.74□□□□□ -2.53
YHR139C-AO13536 YBR178WYBR178W 375 nt-0.75□□□□□ -2.53
YHR139C-AO13536 snR48snR48 113 nt-0.75□□□□□ -2.53
YHR139C-AO13536 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.77□□□□□ -2.53
YHR139C-AO13536 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-0.77□□□□□ -2.53
YHR139C-AO13536 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt-0.78□□□□□ -2.53
YHR139C-AO13536 snR52snR52 92 nt-0.79□□□□□ -2.54
YHR139C-AO13536 snR67snR67 82 nt-0.8□□□□□ -2.54
YHR139C-AO13536 snR161snR161 161 nt-0.81□□□□□ -2.54
YHR139C-AO13536 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-0.82□□□□□ -2.54
YHR139C-AO13536 YNL205CYNL205C 423 nt-0.82□□□□□ -2.54
YHR139C-AO13536 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt-0.85□□□□□ -2.55
YHR139C-AO13536 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.87□□□□□ -2.55
YHR139C-AO13536 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt-0.9□□□□□ -2.55
YHR139C-AO13536 YBL053WYBL053W 375 nt-0.92□□□□□ -2.56
YHR139C-AO13536 YOR102WYOR102W 351 nt-0.92□□□□□ -2.56
YHR139C-AO13536 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt-0.93□□□□□ -2.56
YHR139C-AO13536 YNL198CYNL198C 303 nt-0.94□□□□□ -2.56
YHR139C-AO13536 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-0.95□□□□□ -2.56
YHR139C-AO13536 YML054C-AYML054C-A 159 nt-0.96□□□□□ -2.56
YHR139C-AO13536 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-0.98□□□□□ -2.57
YHR139C-AO13536 YJL150WYJL150W 303 nt-0.99□□□□□ -2.57
YHR139C-AO13536 snR77snR77 88 nt-1□□□□□ -2.57
YHR139C-AO13536 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.02□□□□□ -2.57
YHR139C-AO13536 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-1.04□□□□□ -2.58
YHR139C-AO13536 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt-1.07□□□□□ -2.58
YHR139C-AO13536 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-1.07□□□□□ -2.58
YHR139C-AO13536 SOM1YEL059C-A 225 nt-1.14□□□□□ -2.59
YHR139C-AO13536 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-1.14□□□□□ -2.59
YHR139C-AO13536 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-1.16□□□□□ -2.6
YHR139C-AO13536 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-1.22□□□□□ -2.6
YHR139C-AO13536 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.23□□□□□ -2.61
YHR139C-AO13536 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt-1.24□□□□□ -2.61
YHR139C-AO13536 SPG3YDR504C 384 nt-1.25□□□□□ -2.61
YHR139C-AO13536 Q0142Q0142 177 nt-1.25□□□□□ -2.61
YHR139C-AO13536 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-1.25□□□□□ -2.61
YHR139C-AO13536 snR81snR81 201 nt-1.26□□□□□ -2.61
YHR139C-AO13536 snR38snR38 95 nt-1.26□□□□□ -2.61
YHR139C-AO13536 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-1.27□□□□□ -2.61
YHR139C-AO13536 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt-1.28□□□□□ -2.61
YHR139C-AO13536 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-1.29□□□□□ -2.62
YHR139C-AO13536 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-1.29□□□□□ -2.62
YHR139C-AO13536 YGR151CYGR151C 336 nt-1.31□□□□□ -2.62
YHR139C-AO13536 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-1.32□□□□□ -2.62
YHR139C-AO13536 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-1.34□□□□□ -2.62
YHR139C-AO13536 RPL41AYDL184C 78 nt-1.36□□□□□ -2.63
YHR139C-AO13536 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt-1.37□□□□□ -2.63
YHR139C-AO13536 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-1.39□□□□□ -2.63
YHR139C-AO13536 YOR309CYOR309C 381 nt-1.39□□□□□ -2.63
YHR139C-AO13536 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt-1.41□□□□□ -2.64
YHR139C-AO13536 YNR077CYNR077C 255 nt-1.41□□□□□ -2.64
YHR139C-AO13536 snR47snR47 99 nt-1.46□□□□□ -2.64
YHR139C-AO13536 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt-1.47□□□□□ -2.64
YHR139C-AO13536 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-1.47□□□□□ -2.64
YHR139C-AO13536 YNL338WYNL338W 159 nt-1.47□□□□□ -2.64
YHR139C-AO13536 snR6snR6 112 nt-1.52□□□□□ -2.65
YHR139C-AO13536 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-1.58□□□□□ -2.66
YHR139C-AO13536 YNL337WYNL337W 255 nt-1.59□□□□□ -2.66
YHR139C-AO13536 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-1.62□□□□□ -2.67
YHR139C-AO13536 YKL225WYKL225W 348 nt-1.65□□□□□ -2.67
YHR139C-AO13536 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-1.65□□□□□ -2.67
YHR139C-AO13536 snR73snR73 106 nt-1.68□□□□□ -2.68
YHR139C-AO13536 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-1.69□□□□□ -2.68
YHR139C-AO13536 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-1.77□□□□□ -2.69
YHR139C-AO13536 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt-1.77□□□□□ -2.69
YHR139C-AO13536 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt-1.77□□□□□ -2.69
YHR139C-AO13536 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.77□□□□□ -2.69
YHR139C-AO13536 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt-1.82□□□□□ -2.7
YHR139C-AO13536 Q0032Q0032 291 nt-1.84□□□□□ -2.7
YHR139C-AO13536 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-1.84□□□□□ -2.7
YHR139C-AO13536 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-1.84□□□□□ -2.7
YHR139C-AO13536 RPL41BYDL133C-A 78 nt-1.85□□□□□ -2.71
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.9 ms