Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAD1O00515 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAD1O00515 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAD1O00515 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LAD1O00515 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAD1O00515 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAD1O00515 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAD1O00515 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAD1O00515 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAD1O00515 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAD1O00515 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAD1O00515 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAD1O00515 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAD1O00515 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAD1O00515 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAD1O00515 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAD1O00515 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAD1O00515 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAD1O00515 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAD1O00515 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAD1O00515 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAD1O00515 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAD1O00515 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAD1O00515 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAD1O00515 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAD1O00515 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAD1O00515 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAD1O00515 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAD1O00515 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LAD1O00515 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAD1O00515 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAD1O00515 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAD1O00515 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAD1O00515 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAD1O00515 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAD1O00515 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAD1O00515 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAD1O00515 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAD1O00515 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAD1O00515 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAD1O00515 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAD1O00515 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAD1O00515 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAD1O00515 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAD1O00515 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAD1O00515 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAD1O00515 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAD1O00515 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LAD1O00515 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAD1O00515 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAD1O00515 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAD1O00515 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAD1O00515 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAD1O00515 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAD1O00515 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAD1O00515 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAD1O00515 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAD1O00515 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAD1O00515 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAD1O00515 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAD1O00515 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAD1O00515 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAD1O00515 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAD1O00515 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAD1O00515 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAD1O00515 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAD1O00515 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAD1O00515 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAD1O00515 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAD1O00515 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAD1O00515 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAD1O00515 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAD1O00515 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAD1O00515 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAD1O00515 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAD1O00515 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAD1O00515 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAD1O00515 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAD1O00515 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAD1O00515 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAD1O00515 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAD1O00515 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAD1O00515 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAD1O00515 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAD1O00515 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAD1O00515 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAD1O00515 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAD1O00515 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAD1O00515 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAD1O00515 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAD1O00515 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAD1O00515 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAD1O00515 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAD1O00515 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAD1O00515 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAD1O00515 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAD1O00515 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAD1O00515 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAD1O00515 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAD1O00515 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms