Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrit3W8DXL4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrit3W8DXL4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrit3W8DXL4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrit3W8DXL4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrit3W8DXL4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrit3W8DXL4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrit3W8DXL4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrit3W8DXL4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrit3W8DXL4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrit3W8DXL4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrit3W8DXL4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrit3W8DXL4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrit3W8DXL4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrit3W8DXL4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrit3W8DXL4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrit3W8DXL4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrit3W8DXL4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrit3W8DXL4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrit3W8DXL4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrit3W8DXL4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrit3W8DXL4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrit3W8DXL4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrit3W8DXL4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrit3W8DXL4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrit3W8DXL4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrit3W8DXL4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrit3W8DXL4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrit3W8DXL4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrit3W8DXL4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrit3W8DXL4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrit3W8DXL4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrit3W8DXL4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrit3W8DXL4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrit3W8DXL4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrit3W8DXL4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrit3W8DXL4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrit3W8DXL4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrit3W8DXL4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrit3W8DXL4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrit3W8DXL4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrit3W8DXL4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrit3W8DXL4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrit3W8DXL4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrit3W8DXL4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrit3W8DXL4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrit3W8DXL4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrit3W8DXL4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrit3W8DXL4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrit3W8DXL4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrit3W8DXL4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrit3W8DXL4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrit3W8DXL4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrit3W8DXL4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrit3W8DXL4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrit3W8DXL4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrit3W8DXL4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrit3W8DXL4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrit3W8DXL4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrit3W8DXL4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrit3W8DXL4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrit3W8DXL4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrit3W8DXL4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrit3W8DXL4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrit3W8DXL4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrit3W8DXL4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrit3W8DXL4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrit3W8DXL4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrit3W8DXL4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrit3W8DXL4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrit3W8DXL4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrit3W8DXL4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrit3W8DXL4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrit3W8DXL4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrit3W8DXL4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrit3W8DXL4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrit3W8DXL4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrit3W8DXL4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrit3W8DXL4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrit3W8DXL4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrit3W8DXL4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrit3W8DXL4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrit3W8DXL4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrit3W8DXL4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrit3W8DXL4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrit3W8DXL4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrit3W8DXL4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrit3W8DXL4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrit3W8DXL4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrit3W8DXL4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrit3W8DXL4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrit3W8DXL4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrit3W8DXL4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrit3W8DXL4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrit3W8DXL4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrit3W8DXL4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrit3W8DXL4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrit3W8DXL4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrit3W8DXL4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrit3W8DXL4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms