Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
Lrit3W8DXL4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Lrit3W8DXL4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Lrit3W8DXL4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Lrit3W8DXL4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
Lrit3W8DXL4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
Lrit3W8DXL4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Lrit3W8DXL4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Lrit3W8DXL4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Lrit3W8DXL4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Lrit3W8DXL4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Lrit3W8DXL4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Lrit3W8DXL4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Lrit3W8DXL4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Lrit3W8DXL4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Lrit3W8DXL4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Lrit3W8DXL4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Lrit3W8DXL4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lrit3W8DXL4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Lrit3W8DXL4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Lrit3W8DXL4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Lrit3W8DXL4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lrit3W8DXL4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Lrit3W8DXL4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lrit3W8DXL4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lrit3W8DXL4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lrit3W8DXL4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Lrit3W8DXL4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lrit3W8DXL4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lrit3W8DXL4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Lrit3W8DXL4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lrit3W8DXL4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lrit3W8DXL4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lrit3W8DXL4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lrit3W8DXL4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lrit3W8DXL4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Lrit3W8DXL4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lrit3W8DXL4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lrit3W8DXL4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lrit3W8DXL4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lrit3W8DXL4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lrit3W8DXL4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lrit3W8DXL4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Lrit3W8DXL4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lrit3W8DXL4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Lrit3W8DXL4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lrit3W8DXL4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lrit3W8DXL4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Lrit3W8DXL4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lrit3W8DXL4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lrit3W8DXL4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Lrit3W8DXL4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lrit3W8DXL4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lrit3W8DXL4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lrit3W8DXL4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lrit3W8DXL4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Lrit3W8DXL4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Lrit3W8DXL4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lrit3W8DXL4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lrit3W8DXL4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lrit3W8DXL4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lrit3W8DXL4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lrit3W8DXL4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Lrit3W8DXL4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lrit3W8DXL4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lrit3W8DXL4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lrit3W8DXL4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Lrit3W8DXL4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lrit3W8DXL4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lrit3W8DXL4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Lrit3W8DXL4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lrit3W8DXL4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lrit3W8DXL4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Lrit3W8DXL4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lrit3W8DXL4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lrit3W8DXL4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Lrit3W8DXL4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lrit3W8DXL4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lrit3W8DXL4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lrit3W8DXL4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lrit3W8DXL4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lrit3W8DXL4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lrit3W8DXL4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lrit3W8DXL4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lrit3W8DXL4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lrit3W8DXL4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lrit3W8DXL4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lrit3W8DXL4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lrit3W8DXL4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lrit3W8DXL4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Lrit3W8DXL4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lrit3W8DXL4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lrit3W8DXL4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lrit3W8DXL4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lrit3W8DXL4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrit3W8DXL4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lrit3W8DXL4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lrit3W8DXL4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Lrit3W8DXL4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lrit3W8DXL4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
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