Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY33

Tspan3, Tetraspanin-3, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan3Q9QY33 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tspan3Q9QY33 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tspan3Q9QY33 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tspan3Q9QY33 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Tspan3Q9QY33 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tspan3Q9QY33 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tspan3Q9QY33 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Tspan3Q9QY33 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tspan3Q9QY33 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tspan3Q9QY33 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tspan3Q9QY33 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tspan3Q9QY33 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Tspan3Q9QY33 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tspan3Q9QY33 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tspan3Q9QY33 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tspan3Q9QY33 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tspan3Q9QY33 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tspan3Q9QY33 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tspan3Q9QY33 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tspan3Q9QY33 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Tspan3Q9QY33 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tspan3Q9QY33 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tspan3Q9QY33 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tspan3Q9QY33 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tspan3Q9QY33 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tspan3Q9QY33 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tspan3Q9QY33 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tspan3Q9QY33 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tspan3Q9QY33 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tspan3Q9QY33 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tspan3Q9QY33 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tspan3Q9QY33 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Tspan3Q9QY33 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tspan3Q9QY33 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tspan3Q9QY33 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tspan3Q9QY33 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tspan3Q9QY33 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tspan3Q9QY33 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tspan3Q9QY33 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tspan3Q9QY33 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tspan3Q9QY33 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tspan3Q9QY33 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tspan3Q9QY33 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tspan3Q9QY33 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tspan3Q9QY33 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tspan3Q9QY33 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Tspan3Q9QY33 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tspan3Q9QY33 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tspan3Q9QY33 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tspan3Q9QY33 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tspan3Q9QY33 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tspan3Q9QY33 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tspan3Q9QY33 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tspan3Q9QY33 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tspan3Q9QY33 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tspan3Q9QY33 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tspan3Q9QY33 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tspan3Q9QY33 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tspan3Q9QY33 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tspan3Q9QY33 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tspan3Q9QY33 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tspan3Q9QY33 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tspan3Q9QY33 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tspan3Q9QY33 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tspan3Q9QY33 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Tspan3Q9QY33 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tspan3Q9QY33 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tspan3Q9QY33 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tspan3Q9QY33 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tspan3Q9QY33 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tspan3Q9QY33 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tspan3Q9QY33 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tspan3Q9QY33 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tspan3Q9QY33 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tspan3Q9QY33 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Tspan3Q9QY33 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tspan3Q9QY33 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tspan3Q9QY33 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tspan3Q9QY33 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tspan3Q9QY33 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tspan3Q9QY33 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tspan3Q9QY33 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tspan3Q9QY33 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tspan3Q9QY33 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tspan3Q9QY33 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Tspan3Q9QY33 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tspan3Q9QY33 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tspan3Q9QY33 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tspan3Q9QY33 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tspan3Q9QY33 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tspan3Q9QY33 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tspan3Q9QY33 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tspan3Q9QY33 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tspan3Q9QY33 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tspan3Q9QY33 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tspan3Q9QY33 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tspan3Q9QY33 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tspan3Q9QY33 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tspan3Q9QY33 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tspan3Q9QY33 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms