Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cdc42ep4Q9JM96 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cdc42ep4Q9JM96 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cdc42ep4Q9JM96 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cdc42ep4Q9JM96 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cdc42ep4Q9JM96 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cdc42ep4Q9JM96 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cdc42ep4Q9JM96 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cdc42ep4Q9JM96 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cdc42ep4Q9JM96 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cdc42ep4Q9JM96 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cdc42ep4Q9JM96 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cdc42ep4Q9JM96 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cdc42ep4Q9JM96 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cdc42ep4Q9JM96 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cdc42ep4Q9JM96 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Cdc42ep4Q9JM96 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Cdc42ep4Q9JM96 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cdc42ep4Q9JM96 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cdc42ep4Q9JM96 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cdc42ep4Q9JM96 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cdc42ep4Q9JM96 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cdc42ep4Q9JM96 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cdc42ep4Q9JM96 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cdc42ep4Q9JM96 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cdc42ep4Q9JM96 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cdc42ep4Q9JM96 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cdc42ep4Q9JM96 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cdc42ep4Q9JM96 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cdc42ep4Q9JM96 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdc42ep4Q9JM96 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdc42ep4Q9JM96 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdc42ep4Q9JM96 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdc42ep4Q9JM96 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdc42ep4Q9JM96 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cdc42ep4Q9JM96 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cdc42ep4Q9JM96 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Cdc42ep4Q9JM96 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdc42ep4Q9JM96 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdc42ep4Q9JM96 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdc42ep4Q9JM96 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdc42ep4Q9JM96 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdc42ep4Q9JM96 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdc42ep4Q9JM96 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdc42ep4Q9JM96 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdc42ep4Q9JM96 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdc42ep4Q9JM96 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdc42ep4Q9JM96 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdc42ep4Q9JM96 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdc42ep4Q9JM96 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cdc42ep4Q9JM96 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cdc42ep4Q9JM96 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdc42ep4Q9JM96 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdc42ep4Q9JM96 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdc42ep4Q9JM96 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdc42ep4Q9JM96 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdc42ep4Q9JM96 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdc42ep4Q9JM96 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdc42ep4Q9JM96 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdc42ep4Q9JM96 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdc42ep4Q9JM96 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdc42ep4Q9JM96 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdc42ep4Q9JM96 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdc42ep4Q9JM96 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdc42ep4Q9JM96 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdc42ep4Q9JM96 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdc42ep4Q9JM96 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdc42ep4Q9JM96 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cdc42ep4Q9JM96 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cdc42ep4Q9JM96 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdc42ep4Q9JM96 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdc42ep4Q9JM96 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdc42ep4Q9JM96 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdc42ep4Q9JM96 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdc42ep4Q9JM96 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdc42ep4Q9JM96 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdc42ep4Q9JM96 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdc42ep4Q9JM96 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdc42ep4Q9JM96 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdc42ep4Q9JM96 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdc42ep4Q9JM96 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdc42ep4Q9JM96 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdc42ep4Q9JM96 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdc42ep4Q9JM96 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdc42ep4Q9JM96 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdc42ep4Q9JM96 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdc42ep4Q9JM96 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdc42ep4Q9JM96 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Cdc42ep4Q9JM96 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdc42ep4Q9JM96 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdc42ep4Q9JM96 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdc42ep4Q9JM96 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdc42ep4Q9JM96 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdc42ep4Q9JM96 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdc42ep4Q9JM96 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdc42ep4Q9JM96 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdc42ep4Q9JM96 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdc42ep4Q9JM96 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdc42ep4Q9JM96 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdc42ep4Q9JM96 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms