Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL21

Ccr10, C-C chemokine receptor type 10, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr10Q9JL21 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccr10Q9JL21 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccr10Q9JL21 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccr10Q9JL21 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccr10Q9JL21 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccr10Q9JL21 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccr10Q9JL21 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccr10Q9JL21 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccr10Q9JL21 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccr10Q9JL21 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccr10Q9JL21 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccr10Q9JL21 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccr10Q9JL21 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccr10Q9JL21 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccr10Q9JL21 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccr10Q9JL21 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccr10Q9JL21 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccr10Q9JL21 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccr10Q9JL21 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccr10Q9JL21 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccr10Q9JL21 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccr10Q9JL21 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccr10Q9JL21 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccr10Q9JL21 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccr10Q9JL21 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccr10Q9JL21 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccr10Q9JL21 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccr10Q9JL21 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccr10Q9JL21 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccr10Q9JL21 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccr10Q9JL21 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccr10Q9JL21 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccr10Q9JL21 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccr10Q9JL21 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccr10Q9JL21 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccr10Q9JL21 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccr10Q9JL21 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccr10Q9JL21 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccr10Q9JL21 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccr10Q9JL21 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccr10Q9JL21 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccr10Q9JL21 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccr10Q9JL21 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccr10Q9JL21 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccr10Q9JL21 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccr10Q9JL21 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccr10Q9JL21 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccr10Q9JL21 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccr10Q9JL21 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccr10Q9JL21 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccr10Q9JL21 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccr10Q9JL21 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccr10Q9JL21 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccr10Q9JL21 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccr10Q9JL21 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccr10Q9JL21 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccr10Q9JL21 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccr10Q9JL21 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccr10Q9JL21 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccr10Q9JL21 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccr10Q9JL21 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccr10Q9JL21 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccr10Q9JL21 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccr10Q9JL21 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccr10Q9JL21 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccr10Q9JL21 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccr10Q9JL21 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccr10Q9JL21 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccr10Q9JL21 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccr10Q9JL21 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccr10Q9JL21 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccr10Q9JL21 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccr10Q9JL21 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccr10Q9JL21 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccr10Q9JL21 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccr10Q9JL21 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccr10Q9JL21 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccr10Q9JL21 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccr10Q9JL21 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccr10Q9JL21 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccr10Q9JL21 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccr10Q9JL21 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccr10Q9JL21 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccr10Q9JL21 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccr10Q9JL21 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccr10Q9JL21 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccr10Q9JL21 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccr10Q9JL21 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccr10Q9JL21 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccr10Q9JL21 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccr10Q9JL21 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccr10Q9JL21 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccr10Q9JL21 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccr10Q9JL21 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccr10Q9JL21 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccr10Q9JL21 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccr10Q9JL21 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccr10Q9JL21 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccr10Q9JL21 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccr10Q9JL21 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms