Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RabggtaQ9JHK4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RabggtaQ9JHK4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RabggtaQ9JHK4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RabggtaQ9JHK4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RabggtaQ9JHK4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RabggtaQ9JHK4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RabggtaQ9JHK4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RabggtaQ9JHK4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RabggtaQ9JHK4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RabggtaQ9JHK4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RabggtaQ9JHK4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RabggtaQ9JHK4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RabggtaQ9JHK4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RabggtaQ9JHK4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RabggtaQ9JHK4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RabggtaQ9JHK4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RabggtaQ9JHK4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RabggtaQ9JHK4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RabggtaQ9JHK4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RabggtaQ9JHK4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RabggtaQ9JHK4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RabggtaQ9JHK4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RabggtaQ9JHK4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RabggtaQ9JHK4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RabggtaQ9JHK4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
RabggtaQ9JHK4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RabggtaQ9JHK4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RabggtaQ9JHK4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RabggtaQ9JHK4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RabggtaQ9JHK4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RabggtaQ9JHK4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RabggtaQ9JHK4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RabggtaQ9JHK4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RabggtaQ9JHK4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RabggtaQ9JHK4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RabggtaQ9JHK4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RabggtaQ9JHK4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RabggtaQ9JHK4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RabggtaQ9JHK4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RabggtaQ9JHK4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RabggtaQ9JHK4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RabggtaQ9JHK4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RabggtaQ9JHK4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RabggtaQ9JHK4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RabggtaQ9JHK4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RabggtaQ9JHK4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RabggtaQ9JHK4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RabggtaQ9JHK4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RabggtaQ9JHK4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RabggtaQ9JHK4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RabggtaQ9JHK4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RabggtaQ9JHK4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RabggtaQ9JHK4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RabggtaQ9JHK4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RabggtaQ9JHK4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RabggtaQ9JHK4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RabggtaQ9JHK4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RabggtaQ9JHK4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RabggtaQ9JHK4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RabggtaQ9JHK4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RabggtaQ9JHK4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RabggtaQ9JHK4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RabggtaQ9JHK4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RabggtaQ9JHK4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RabggtaQ9JHK4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RabggtaQ9JHK4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RabggtaQ9JHK4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RabggtaQ9JHK4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RabggtaQ9JHK4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RabggtaQ9JHK4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RabggtaQ9JHK4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RabggtaQ9JHK4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RabggtaQ9JHK4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RabggtaQ9JHK4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RabggtaQ9JHK4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
RabggtaQ9JHK4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RabggtaQ9JHK4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RabggtaQ9JHK4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RabggtaQ9JHK4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RabggtaQ9JHK4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RabggtaQ9JHK4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RabggtaQ9JHK4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RabggtaQ9JHK4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RabggtaQ9JHK4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RabggtaQ9JHK4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RabggtaQ9JHK4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RabggtaQ9JHK4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RabggtaQ9JHK4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RabggtaQ9JHK4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RabggtaQ9JHK4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RabggtaQ9JHK4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RabggtaQ9JHK4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RabggtaQ9JHK4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RabggtaQ9JHK4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RabggtaQ9JHK4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RabggtaQ9JHK4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RabggtaQ9JHK4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RabggtaQ9JHK4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RabggtaQ9JHK4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
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