Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHE7

Tssc4, Protein TSSC4, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tssc4Q9JHE7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tssc4Q9JHE7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tssc4Q9JHE7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tssc4Q9JHE7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Tssc4Q9JHE7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tssc4Q9JHE7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tssc4Q9JHE7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tssc4Q9JHE7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tssc4Q9JHE7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tssc4Q9JHE7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tssc4Q9JHE7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tssc4Q9JHE7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tssc4Q9JHE7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tssc4Q9JHE7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Tssc4Q9JHE7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Tssc4Q9JHE7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tssc4Q9JHE7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tssc4Q9JHE7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tssc4Q9JHE7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tssc4Q9JHE7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tssc4Q9JHE7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tssc4Q9JHE7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tssc4Q9JHE7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tssc4Q9JHE7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tssc4Q9JHE7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tssc4Q9JHE7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tssc4Q9JHE7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tssc4Q9JHE7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tssc4Q9JHE7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tssc4Q9JHE7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Tssc4Q9JHE7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tssc4Q9JHE7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tssc4Q9JHE7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tssc4Q9JHE7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tssc4Q9JHE7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tssc4Q9JHE7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tssc4Q9JHE7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tssc4Q9JHE7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Tssc4Q9JHE7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tssc4Q9JHE7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tssc4Q9JHE7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tssc4Q9JHE7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tssc4Q9JHE7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Tssc4Q9JHE7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tssc4Q9JHE7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tssc4Q9JHE7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tssc4Q9JHE7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tssc4Q9JHE7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tssc4Q9JHE7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tssc4Q9JHE7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tssc4Q9JHE7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tssc4Q9JHE7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tssc4Q9JHE7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tssc4Q9JHE7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tssc4Q9JHE7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tssc4Q9JHE7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tssc4Q9JHE7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tssc4Q9JHE7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tssc4Q9JHE7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tssc4Q9JHE7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tssc4Q9JHE7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tssc4Q9JHE7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tssc4Q9JHE7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tssc4Q9JHE7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tssc4Q9JHE7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tssc4Q9JHE7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tssc4Q9JHE7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tssc4Q9JHE7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tssc4Q9JHE7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tssc4Q9JHE7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tssc4Q9JHE7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tssc4Q9JHE7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tssc4Q9JHE7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tssc4Q9JHE7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tssc4Q9JHE7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tssc4Q9JHE7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tssc4Q9JHE7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tssc4Q9JHE7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Tssc4Q9JHE7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Tssc4Q9JHE7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tssc4Q9JHE7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tssc4Q9JHE7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tssc4Q9JHE7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tssc4Q9JHE7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tssc4Q9JHE7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tssc4Q9JHE7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tssc4Q9JHE7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tssc4Q9JHE7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tssc4Q9JHE7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tssc4Q9JHE7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tssc4Q9JHE7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tssc4Q9JHE7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tssc4Q9JHE7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tssc4Q9JHE7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tssc4Q9JHE7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tssc4Q9JHE7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tssc4Q9JHE7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tssc4Q9JHE7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tssc4Q9JHE7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tssc4Q9JHE7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms