Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESM6

Gdpd2, Glycerophosphoinositol inositolphosphodiesterase GDPD2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd2Q9ESM6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gdpd2Q9ESM6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gdpd2Q9ESM6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gdpd2Q9ESM6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gdpd2Q9ESM6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gdpd2Q9ESM6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gdpd2Q9ESM6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gdpd2Q9ESM6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gdpd2Q9ESM6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gdpd2Q9ESM6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gdpd2Q9ESM6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Gdpd2Q9ESM6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gdpd2Q9ESM6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Gdpd2Q9ESM6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gdpd2Q9ESM6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gdpd2Q9ESM6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gdpd2Q9ESM6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gdpd2Q9ESM6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gdpd2Q9ESM6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Gdpd2Q9ESM6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gdpd2Q9ESM6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gdpd2Q9ESM6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gdpd2Q9ESM6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gdpd2Q9ESM6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gdpd2Q9ESM6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gdpd2Q9ESM6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gdpd2Q9ESM6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gdpd2Q9ESM6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gdpd2Q9ESM6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gdpd2Q9ESM6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gdpd2Q9ESM6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gdpd2Q9ESM6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gdpd2Q9ESM6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gdpd2Q9ESM6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gdpd2Q9ESM6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gdpd2Q9ESM6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Gdpd2Q9ESM6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gdpd2Q9ESM6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gdpd2Q9ESM6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gdpd2Q9ESM6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gdpd2Q9ESM6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gdpd2Q9ESM6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gdpd2Q9ESM6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gdpd2Q9ESM6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gdpd2Q9ESM6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gdpd2Q9ESM6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gdpd2Q9ESM6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gdpd2Q9ESM6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gdpd2Q9ESM6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gdpd2Q9ESM6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gdpd2Q9ESM6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gdpd2Q9ESM6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gdpd2Q9ESM6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gdpd2Q9ESM6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gdpd2Q9ESM6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gdpd2Q9ESM6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gdpd2Q9ESM6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gdpd2Q9ESM6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gdpd2Q9ESM6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gdpd2Q9ESM6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gdpd2Q9ESM6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Gdpd2Q9ESM6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gdpd2Q9ESM6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gdpd2Q9ESM6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gdpd2Q9ESM6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gdpd2Q9ESM6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gdpd2Q9ESM6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gdpd2Q9ESM6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gdpd2Q9ESM6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gdpd2Q9ESM6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gdpd2Q9ESM6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gdpd2Q9ESM6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gdpd2Q9ESM6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gdpd2Q9ESM6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gdpd2Q9ESM6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Gdpd2Q9ESM6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gdpd2Q9ESM6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gdpd2Q9ESM6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gdpd2Q9ESM6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gdpd2Q9ESM6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gdpd2Q9ESM6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gdpd2Q9ESM6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gdpd2Q9ESM6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gdpd2Q9ESM6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gdpd2Q9ESM6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gdpd2Q9ESM6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gdpd2Q9ESM6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gdpd2Q9ESM6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gdpd2Q9ESM6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gdpd2Q9ESM6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gdpd2Q9ESM6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gdpd2Q9ESM6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Gdpd2Q9ESM6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gdpd2Q9ESM6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Gdpd2Q9ESM6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Gdpd2Q9ESM6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gdpd2Q9ESM6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gdpd2Q9ESM6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gdpd2Q9ESM6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gdpd2Q9ESM6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.5 ms