Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prpf4Q9DAW6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prpf4Q9DAW6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prpf4Q9DAW6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prpf4Q9DAW6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prpf4Q9DAW6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prpf4Q9DAW6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prpf4Q9DAW6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prpf4Q9DAW6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prpf4Q9DAW6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prpf4Q9DAW6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prpf4Q9DAW6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prpf4Q9DAW6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prpf4Q9DAW6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prpf4Q9DAW6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Prpf4Q9DAW6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prpf4Q9DAW6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prpf4Q9DAW6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prpf4Q9DAW6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prpf4Q9DAW6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prpf4Q9DAW6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prpf4Q9DAW6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prpf4Q9DAW6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prpf4Q9DAW6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prpf4Q9DAW6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prpf4Q9DAW6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prpf4Q9DAW6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prpf4Q9DAW6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prpf4Q9DAW6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prpf4Q9DAW6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prpf4Q9DAW6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prpf4Q9DAW6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prpf4Q9DAW6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prpf4Q9DAW6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prpf4Q9DAW6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prpf4Q9DAW6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prpf4Q9DAW6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prpf4Q9DAW6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prpf4Q9DAW6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prpf4Q9DAW6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prpf4Q9DAW6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prpf4Q9DAW6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prpf4Q9DAW6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prpf4Q9DAW6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prpf4Q9DAW6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prpf4Q9DAW6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prpf4Q9DAW6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prpf4Q9DAW6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prpf4Q9DAW6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prpf4Q9DAW6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prpf4Q9DAW6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prpf4Q9DAW6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prpf4Q9DAW6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prpf4Q9DAW6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prpf4Q9DAW6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prpf4Q9DAW6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prpf4Q9DAW6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prpf4Q9DAW6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prpf4Q9DAW6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prpf4Q9DAW6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prpf4Q9DAW6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prpf4Q9DAW6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prpf4Q9DAW6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prpf4Q9DAW6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prpf4Q9DAW6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prpf4Q9DAW6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prpf4Q9DAW6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prpf4Q9DAW6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prpf4Q9DAW6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prpf4Q9DAW6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prpf4Q9DAW6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prpf4Q9DAW6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prpf4Q9DAW6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prpf4Q9DAW6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prpf4Q9DAW6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prpf4Q9DAW6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prpf4Q9DAW6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prpf4Q9DAW6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Prpf4Q9DAW6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Prpf4Q9DAW6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prpf4Q9DAW6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prpf4Q9DAW6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prpf4Q9DAW6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prpf4Q9DAW6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prpf4Q9DAW6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prpf4Q9DAW6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prpf4Q9DAW6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prpf4Q9DAW6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prpf4Q9DAW6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prpf4Q9DAW6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prpf4Q9DAW6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prpf4Q9DAW6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prpf4Q9DAW6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prpf4Q9DAW6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prpf4Q9DAW6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prpf4Q9DAW6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Prpf4Q9DAW6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prpf4Q9DAW6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prpf4Q9DAW6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prpf4Q9DAW6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms