Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Chmp5Q9D7S9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Chmp5Q9D7S9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Chmp5Q9D7S9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Chmp5Q9D7S9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Chmp5Q9D7S9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Chmp5Q9D7S9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Chmp5Q9D7S9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Chmp5Q9D7S9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Chmp5Q9D7S9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Chmp5Q9D7S9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Chmp5Q9D7S9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Chmp5Q9D7S9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Chmp5Q9D7S9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Chmp5Q9D7S9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Chmp5Q9D7S9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Chmp5Q9D7S9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Chmp5Q9D7S9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Chmp5Q9D7S9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Chmp5Q9D7S9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Chmp5Q9D7S9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Chmp5Q9D7S9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Chmp5Q9D7S9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Chmp5Q9D7S9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Chmp5Q9D7S9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Chmp5Q9D7S9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Chmp5Q9D7S9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Chmp5Q9D7S9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Chmp5Q9D7S9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Chmp5Q9D7S9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Chmp5Q9D7S9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Chmp5Q9D7S9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Chmp5Q9D7S9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Chmp5Q9D7S9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Chmp5Q9D7S9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Chmp5Q9D7S9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Chmp5Q9D7S9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Chmp5Q9D7S9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Chmp5Q9D7S9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Chmp5Q9D7S9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Chmp5Q9D7S9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Chmp5Q9D7S9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Chmp5Q9D7S9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Chmp5Q9D7S9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Chmp5Q9D7S9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Chmp5Q9D7S9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Chmp5Q9D7S9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Chmp5Q9D7S9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Chmp5Q9D7S9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Chmp5Q9D7S9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Chmp5Q9D7S9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Chmp5Q9D7S9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Chmp5Q9D7S9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Chmp5Q9D7S9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Chmp5Q9D7S9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Chmp5Q9D7S9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Chmp5Q9D7S9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Chmp5Q9D7S9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Chmp5Q9D7S9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Chmp5Q9D7S9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Chmp5Q9D7S9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Chmp5Q9D7S9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Chmp5Q9D7S9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Chmp5Q9D7S9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Chmp5Q9D7S9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Chmp5Q9D7S9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Chmp5Q9D7S9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Chmp5Q9D7S9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Chmp5Q9D7S9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Chmp5Q9D7S9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Chmp5Q9D7S9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Chmp5Q9D7S9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Chmp5Q9D7S9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Chmp5Q9D7S9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Chmp5Q9D7S9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Chmp5Q9D7S9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Chmp5Q9D7S9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Chmp5Q9D7S9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Chmp5Q9D7S9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Chmp5Q9D7S9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Chmp5Q9D7S9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Chmp5Q9D7S9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Chmp5Q9D7S9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Chmp5Q9D7S9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Chmp5Q9D7S9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Chmp5Q9D7S9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Chmp5Q9D7S9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Chmp5Q9D7S9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Chmp5Q9D7S9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Chmp5Q9D7S9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Chmp5Q9D7S9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Chmp5Q9D7S9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Chmp5Q9D7S9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Chmp5Q9D7S9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Chmp5Q9D7S9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Chmp5Q9D7S9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Chmp5Q9D7S9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Chmp5Q9D7S9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Chmp5Q9D7S9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Chmp5Q9D7S9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms