Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Stag1Q9D3E6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Stag1Q9D3E6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Stag1Q9D3E6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Stag1Q9D3E6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Stag1Q9D3E6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Stag1Q9D3E6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Stag1Q9D3E6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Stag1Q9D3E6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Stag1Q9D3E6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Stag1Q9D3E6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Stag1Q9D3E6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Stag1Q9D3E6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Stag1Q9D3E6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Stag1Q9D3E6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Stag1Q9D3E6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Stag1Q9D3E6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Stag1Q9D3E6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Stag1Q9D3E6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Stag1Q9D3E6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Stag1Q9D3E6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Stag1Q9D3E6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Stag1Q9D3E6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Stag1Q9D3E6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Stag1Q9D3E6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Stag1Q9D3E6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Stag1Q9D3E6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Stag1Q9D3E6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Stag1Q9D3E6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Stag1Q9D3E6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Stag1Q9D3E6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Stag1Q9D3E6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Stag1Q9D3E6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Stag1Q9D3E6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Stag1Q9D3E6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Stag1Q9D3E6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Stag1Q9D3E6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Stag1Q9D3E6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Stag1Q9D3E6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Stag1Q9D3E6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Stag1Q9D3E6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Stag1Q9D3E6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Stag1Q9D3E6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Stag1Q9D3E6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Stag1Q9D3E6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Stag1Q9D3E6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Stag1Q9D3E6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Stag1Q9D3E6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Stag1Q9D3E6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Stag1Q9D3E6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Stag1Q9D3E6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Stag1Q9D3E6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Stag1Q9D3E6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Stag1Q9D3E6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Stag1Q9D3E6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Stag1Q9D3E6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Stag1Q9D3E6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Stag1Q9D3E6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Stag1Q9D3E6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Stag1Q9D3E6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Stag1Q9D3E6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Stag1Q9D3E6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Stag1Q9D3E6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Stag1Q9D3E6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Stag1Q9D3E6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Stag1Q9D3E6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Stag1Q9D3E6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Stag1Q9D3E6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Stag1Q9D3E6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Stag1Q9D3E6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Stag1Q9D3E6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Stag1Q9D3E6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Stag1Q9D3E6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Stag1Q9D3E6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Stag1Q9D3E6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Stag1Q9D3E6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Stag1Q9D3E6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Stag1Q9D3E6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Stag1Q9D3E6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Stag1Q9D3E6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Stag1Q9D3E6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Stag1Q9D3E6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Stag1Q9D3E6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Stag1Q9D3E6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Stag1Q9D3E6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Stag1Q9D3E6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Stag1Q9D3E6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Stag1Q9D3E6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Stag1Q9D3E6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Stag1Q9D3E6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Stag1Q9D3E6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Stag1Q9D3E6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Stag1Q9D3E6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Stag1Q9D3E6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Stag1Q9D3E6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Stag1Q9D3E6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Stag1Q9D3E6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Stag1Q9D3E6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Stag1Q9D3E6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Stag1Q9D3E6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.7 ms