Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA4

Msmo1, Methylsterol monooxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msmo1Q9CRA4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Msmo1Q9CRA4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Msmo1Q9CRA4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Msmo1Q9CRA4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Msmo1Q9CRA4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Msmo1Q9CRA4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Msmo1Q9CRA4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Msmo1Q9CRA4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Msmo1Q9CRA4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Msmo1Q9CRA4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Msmo1Q9CRA4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Msmo1Q9CRA4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Msmo1Q9CRA4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Msmo1Q9CRA4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Msmo1Q9CRA4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Msmo1Q9CRA4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Msmo1Q9CRA4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Msmo1Q9CRA4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Msmo1Q9CRA4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Msmo1Q9CRA4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Msmo1Q9CRA4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Msmo1Q9CRA4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Msmo1Q9CRA4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Msmo1Q9CRA4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Msmo1Q9CRA4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Msmo1Q9CRA4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Msmo1Q9CRA4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Msmo1Q9CRA4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Msmo1Q9CRA4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Msmo1Q9CRA4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Msmo1Q9CRA4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Msmo1Q9CRA4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Msmo1Q9CRA4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Msmo1Q9CRA4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Msmo1Q9CRA4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Msmo1Q9CRA4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Msmo1Q9CRA4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Msmo1Q9CRA4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Msmo1Q9CRA4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Msmo1Q9CRA4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Msmo1Q9CRA4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Msmo1Q9CRA4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Msmo1Q9CRA4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Msmo1Q9CRA4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Msmo1Q9CRA4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Msmo1Q9CRA4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Msmo1Q9CRA4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Msmo1Q9CRA4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Msmo1Q9CRA4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Msmo1Q9CRA4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Msmo1Q9CRA4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Msmo1Q9CRA4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Msmo1Q9CRA4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Msmo1Q9CRA4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Msmo1Q9CRA4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Msmo1Q9CRA4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Msmo1Q9CRA4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Msmo1Q9CRA4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Msmo1Q9CRA4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Msmo1Q9CRA4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Msmo1Q9CRA4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Msmo1Q9CRA4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Msmo1Q9CRA4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Msmo1Q9CRA4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Msmo1Q9CRA4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Msmo1Q9CRA4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Msmo1Q9CRA4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Msmo1Q9CRA4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Msmo1Q9CRA4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Msmo1Q9CRA4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Msmo1Q9CRA4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Msmo1Q9CRA4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Msmo1Q9CRA4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Msmo1Q9CRA4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Msmo1Q9CRA4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Msmo1Q9CRA4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Msmo1Q9CRA4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Msmo1Q9CRA4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Msmo1Q9CRA4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Msmo1Q9CRA4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Msmo1Q9CRA4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Msmo1Q9CRA4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Msmo1Q9CRA4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Msmo1Q9CRA4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Msmo1Q9CRA4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Msmo1Q9CRA4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Msmo1Q9CRA4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Msmo1Q9CRA4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Msmo1Q9CRA4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Msmo1Q9CRA4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Msmo1Q9CRA4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Msmo1Q9CRA4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Msmo1Q9CRA4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Msmo1Q9CRA4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Msmo1Q9CRA4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Msmo1Q9CRA4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Msmo1Q9CRA4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Msmo1Q9CRA4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Msmo1Q9CRA4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Msmo1Q9CRA4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.9 ms