Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PsenenQ9CQR7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PsenenQ9CQR7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PsenenQ9CQR7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PsenenQ9CQR7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PsenenQ9CQR7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PsenenQ9CQR7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PsenenQ9CQR7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PsenenQ9CQR7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PsenenQ9CQR7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PsenenQ9CQR7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PsenenQ9CQR7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PsenenQ9CQR7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PsenenQ9CQR7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PsenenQ9CQR7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PsenenQ9CQR7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PsenenQ9CQR7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PsenenQ9CQR7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PsenenQ9CQR7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PsenenQ9CQR7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PsenenQ9CQR7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PsenenQ9CQR7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PsenenQ9CQR7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PsenenQ9CQR7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PsenenQ9CQR7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PsenenQ9CQR7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PsenenQ9CQR7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PsenenQ9CQR7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PsenenQ9CQR7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PsenenQ9CQR7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PsenenQ9CQR7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PsenenQ9CQR7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PsenenQ9CQR7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PsenenQ9CQR7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PsenenQ9CQR7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PsenenQ9CQR7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PsenenQ9CQR7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PsenenQ9CQR7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PsenenQ9CQR7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PsenenQ9CQR7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PsenenQ9CQR7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PsenenQ9CQR7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PsenenQ9CQR7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PsenenQ9CQR7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PsenenQ9CQR7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PsenenQ9CQR7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PsenenQ9CQR7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PsenenQ9CQR7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PsenenQ9CQR7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PsenenQ9CQR7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PsenenQ9CQR7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PsenenQ9CQR7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PsenenQ9CQR7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PsenenQ9CQR7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PsenenQ9CQR7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PsenenQ9CQR7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PsenenQ9CQR7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PsenenQ9CQR7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PsenenQ9CQR7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PsenenQ9CQR7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PsenenQ9CQR7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PsenenQ9CQR7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PsenenQ9CQR7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PsenenQ9CQR7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PsenenQ9CQR7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PsenenQ9CQR7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PsenenQ9CQR7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PsenenQ9CQR7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PsenenQ9CQR7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PsenenQ9CQR7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PsenenQ9CQR7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PsenenQ9CQR7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PsenenQ9CQR7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PsenenQ9CQR7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PsenenQ9CQR7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PsenenQ9CQR7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PsenenQ9CQR7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PsenenQ9CQR7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PsenenQ9CQR7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PsenenQ9CQR7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PsenenQ9CQR7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PsenenQ9CQR7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PsenenQ9CQR7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PsenenQ9CQR7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PsenenQ9CQR7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PsenenQ9CQR7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PsenenQ9CQR7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PsenenQ9CQR7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PsenenQ9CQR7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PsenenQ9CQR7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PsenenQ9CQR7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PsenenQ9CQR7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PsenenQ9CQR7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PsenenQ9CQR7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PsenenQ9CQR7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PsenenQ9CQR7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PsenenQ9CQR7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PsenenQ9CQR7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PsenenQ9CQR7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PsenenQ9CQR7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms