Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nudt21Q9CQF3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nudt21Q9CQF3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nudt21Q9CQF3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nudt21Q9CQF3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nudt21Q9CQF3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nudt21Q9CQF3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nudt21Q9CQF3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nudt21Q9CQF3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nudt21Q9CQF3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nudt21Q9CQF3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nudt21Q9CQF3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nudt21Q9CQF3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nudt21Q9CQF3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nudt21Q9CQF3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nudt21Q9CQF3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nudt21Q9CQF3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nudt21Q9CQF3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nudt21Q9CQF3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nudt21Q9CQF3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nudt21Q9CQF3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Nudt21Q9CQF3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nudt21Q9CQF3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nudt21Q9CQF3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nudt21Q9CQF3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nudt21Q9CQF3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nudt21Q9CQF3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nudt21Q9CQF3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nudt21Q9CQF3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nudt21Q9CQF3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nudt21Q9CQF3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nudt21Q9CQF3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nudt21Q9CQF3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nudt21Q9CQF3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nudt21Q9CQF3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nudt21Q9CQF3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nudt21Q9CQF3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nudt21Q9CQF3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nudt21Q9CQF3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nudt21Q9CQF3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nudt21Q9CQF3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Nudt21Q9CQF3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nudt21Q9CQF3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nudt21Q9CQF3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nudt21Q9CQF3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nudt21Q9CQF3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nudt21Q9CQF3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nudt21Q9CQF3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nudt21Q9CQF3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nudt21Q9CQF3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nudt21Q9CQF3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nudt21Q9CQF3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nudt21Q9CQF3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nudt21Q9CQF3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nudt21Q9CQF3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nudt21Q9CQF3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nudt21Q9CQF3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nudt21Q9CQF3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nudt21Q9CQF3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nudt21Q9CQF3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Nudt21Q9CQF3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nudt21Q9CQF3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Nudt21Q9CQF3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nudt21Q9CQF3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nudt21Q9CQF3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Nudt21Q9CQF3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nudt21Q9CQF3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Nudt21Q9CQF3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nudt21Q9CQF3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nudt21Q9CQF3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nudt21Q9CQF3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nudt21Q9CQF3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Nudt21Q9CQF3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nudt21Q9CQF3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nudt21Q9CQF3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nudt21Q9CQF3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nudt21Q9CQF3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nudt21Q9CQF3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nudt21Q9CQF3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nudt21Q9CQF3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nudt21Q9CQF3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nudt21Q9CQF3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nudt21Q9CQF3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nudt21Q9CQF3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nudt21Q9CQF3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nudt21Q9CQF3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nudt21Q9CQF3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nudt21Q9CQF3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nudt21Q9CQF3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nudt21Q9CQF3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nudt21Q9CQF3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nudt21Q9CQF3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nudt21Q9CQF3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nudt21Q9CQF3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nudt21Q9CQF3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nudt21Q9CQF3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nudt21Q9CQF3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nudt21Q9CQF3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nudt21Q9CQF3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nudt21Q9CQF3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms