Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Chmp3Q9CQ10 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Chmp3Q9CQ10 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Chmp3Q9CQ10 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Chmp3Q9CQ10 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Chmp3Q9CQ10 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Chmp3Q9CQ10 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Chmp3Q9CQ10 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Chmp3Q9CQ10 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Chmp3Q9CQ10 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Chmp3Q9CQ10 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Chmp3Q9CQ10 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Chmp3Q9CQ10 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Chmp3Q9CQ10 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Chmp3Q9CQ10 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Chmp3Q9CQ10 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Chmp3Q9CQ10 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Chmp3Q9CQ10 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Chmp3Q9CQ10 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Chmp3Q9CQ10 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Chmp3Q9CQ10 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Chmp3Q9CQ10 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Chmp3Q9CQ10 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Chmp3Q9CQ10 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Chmp3Q9CQ10 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Chmp3Q9CQ10 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Chmp3Q9CQ10 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Chmp3Q9CQ10 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Chmp3Q9CQ10 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Chmp3Q9CQ10 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Chmp3Q9CQ10 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Chmp3Q9CQ10 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Chmp3Q9CQ10 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Chmp3Q9CQ10 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Chmp3Q9CQ10 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Chmp3Q9CQ10 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Chmp3Q9CQ10 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Chmp3Q9CQ10 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Chmp3Q9CQ10 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Chmp3Q9CQ10 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Chmp3Q9CQ10 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Chmp3Q9CQ10 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Chmp3Q9CQ10 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Chmp3Q9CQ10 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Chmp3Q9CQ10 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Chmp3Q9CQ10 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Chmp3Q9CQ10 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Chmp3Q9CQ10 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Chmp3Q9CQ10 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Chmp3Q9CQ10 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Chmp3Q9CQ10 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Chmp3Q9CQ10 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Chmp3Q9CQ10 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Chmp3Q9CQ10 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Chmp3Q9CQ10 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Chmp3Q9CQ10 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Chmp3Q9CQ10 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Chmp3Q9CQ10 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Chmp3Q9CQ10 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Chmp3Q9CQ10 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Chmp3Q9CQ10 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Chmp3Q9CQ10 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Chmp3Q9CQ10 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Chmp3Q9CQ10 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Chmp3Q9CQ10 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Chmp3Q9CQ10 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Chmp3Q9CQ10 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Chmp3Q9CQ10 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Chmp3Q9CQ10 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Chmp3Q9CQ10 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Chmp3Q9CQ10 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Chmp3Q9CQ10 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Chmp3Q9CQ10 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Chmp3Q9CQ10 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Chmp3Q9CQ10 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Chmp3Q9CQ10 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Chmp3Q9CQ10 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Chmp3Q9CQ10 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Chmp3Q9CQ10 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Chmp3Q9CQ10 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Chmp3Q9CQ10 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Chmp3Q9CQ10 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Chmp3Q9CQ10 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Chmp3Q9CQ10 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Chmp3Q9CQ10 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Chmp3Q9CQ10 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Chmp3Q9CQ10 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Chmp3Q9CQ10 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Chmp3Q9CQ10 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Chmp3Q9CQ10 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Chmp3Q9CQ10 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Chmp3Q9CQ10 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Chmp3Q9CQ10 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Chmp3Q9CQ10 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Chmp3Q9CQ10 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Chmp3Q9CQ10 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Chmp3Q9CQ10 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Chmp3Q9CQ10 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Chmp3Q9CQ10 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Chmp3Q9CQ10 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms