Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD6

Vill, Villin-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VillQ91YD6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VillQ91YD6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VillQ91YD6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VillQ91YD6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VillQ91YD6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VillQ91YD6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
VillQ91YD6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
VillQ91YD6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VillQ91YD6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VillQ91YD6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VillQ91YD6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VillQ91YD6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VillQ91YD6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VillQ91YD6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VillQ91YD6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VillQ91YD6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VillQ91YD6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VillQ91YD6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VillQ91YD6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
VillQ91YD6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VillQ91YD6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
VillQ91YD6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
VillQ91YD6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VillQ91YD6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VillQ91YD6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VillQ91YD6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VillQ91YD6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VillQ91YD6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
VillQ91YD6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VillQ91YD6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VillQ91YD6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VillQ91YD6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VillQ91YD6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VillQ91YD6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VillQ91YD6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VillQ91YD6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VillQ91YD6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VillQ91YD6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VillQ91YD6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VillQ91YD6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VillQ91YD6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VillQ91YD6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VillQ91YD6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VillQ91YD6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VillQ91YD6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VillQ91YD6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VillQ91YD6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VillQ91YD6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VillQ91YD6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VillQ91YD6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VillQ91YD6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VillQ91YD6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VillQ91YD6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VillQ91YD6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VillQ91YD6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VillQ91YD6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VillQ91YD6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VillQ91YD6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VillQ91YD6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VillQ91YD6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VillQ91YD6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VillQ91YD6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VillQ91YD6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
VillQ91YD6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
VillQ91YD6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VillQ91YD6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VillQ91YD6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VillQ91YD6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VillQ91YD6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VillQ91YD6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VillQ91YD6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VillQ91YD6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VillQ91YD6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VillQ91YD6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VillQ91YD6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VillQ91YD6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VillQ91YD6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VillQ91YD6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VillQ91YD6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VillQ91YD6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VillQ91YD6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VillQ91YD6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VillQ91YD6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VillQ91YD6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VillQ91YD6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VillQ91YD6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VillQ91YD6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VillQ91YD6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VillQ91YD6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VillQ91YD6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VillQ91YD6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VillQ91YD6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VillQ91YD6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VillQ91YD6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VillQ91YD6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VillQ91YD6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VillQ91YD6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VillQ91YD6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VillQ91YD6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VillQ91YD6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms