Protein–RNA interactions for Protein: Q91W92

Cdc42ep1, Cdc42 effector protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep1Q91W92 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdc42ep1Q91W92 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdc42ep1Q91W92 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdc42ep1Q91W92 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdc42ep1Q91W92 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdc42ep1Q91W92 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdc42ep1Q91W92 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdc42ep1Q91W92 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdc42ep1Q91W92 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdc42ep1Q91W92 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdc42ep1Q91W92 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdc42ep1Q91W92 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdc42ep1Q91W92 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdc42ep1Q91W92 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdc42ep1Q91W92 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdc42ep1Q91W92 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc42ep1Q91W92 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc42ep1Q91W92 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc42ep1Q91W92 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdc42ep1Q91W92 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdc42ep1Q91W92 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc42ep1Q91W92 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc42ep1Q91W92 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc42ep1Q91W92 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdc42ep1Q91W92 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdc42ep1Q91W92 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdc42ep1Q91W92 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdc42ep1Q91W92 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdc42ep1Q91W92 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdc42ep1Q91W92 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdc42ep1Q91W92 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdc42ep1Q91W92 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdc42ep1Q91W92 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdc42ep1Q91W92 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdc42ep1Q91W92 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdc42ep1Q91W92 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdc42ep1Q91W92 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdc42ep1Q91W92 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdc42ep1Q91W92 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdc42ep1Q91W92 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdc42ep1Q91W92 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdc42ep1Q91W92 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdc42ep1Q91W92 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdc42ep1Q91W92 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdc42ep1Q91W92 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdc42ep1Q91W92 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdc42ep1Q91W92 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdc42ep1Q91W92 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdc42ep1Q91W92 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdc42ep1Q91W92 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdc42ep1Q91W92 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdc42ep1Q91W92 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdc42ep1Q91W92 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdc42ep1Q91W92 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdc42ep1Q91W92 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdc42ep1Q91W92 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdc42ep1Q91W92 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdc42ep1Q91W92 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdc42ep1Q91W92 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdc42ep1Q91W92 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdc42ep1Q91W92 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdc42ep1Q91W92 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdc42ep1Q91W92 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdc42ep1Q91W92 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdc42ep1Q91W92 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdc42ep1Q91W92 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdc42ep1Q91W92 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdc42ep1Q91W92 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdc42ep1Q91W92 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdc42ep1Q91W92 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdc42ep1Q91W92 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdc42ep1Q91W92 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdc42ep1Q91W92 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdc42ep1Q91W92 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdc42ep1Q91W92 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdc42ep1Q91W92 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdc42ep1Q91W92 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdc42ep1Q91W92 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdc42ep1Q91W92 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdc42ep1Q91W92 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdc42ep1Q91W92 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdc42ep1Q91W92 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdc42ep1Q91W92 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdc42ep1Q91W92 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdc42ep1Q91W92 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdc42ep1Q91W92 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdc42ep1Q91W92 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdc42ep1Q91W92 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdc42ep1Q91W92 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdc42ep1Q91W92 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdc42ep1Q91W92 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdc42ep1Q91W92 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdc42ep1Q91W92 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdc42ep1Q91W92 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdc42ep1Q91W92 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdc42ep1Q91W92 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdc42ep1Q91W92 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdc42ep1Q91W92 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdc42ep1Q91W92 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdc42ep1Q91W92 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms