Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDR7

Tgds, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgdsQ8VDR7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TgdsQ8VDR7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TgdsQ8VDR7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TgdsQ8VDR7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TgdsQ8VDR7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TgdsQ8VDR7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TgdsQ8VDR7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TgdsQ8VDR7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TgdsQ8VDR7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TgdsQ8VDR7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TgdsQ8VDR7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TgdsQ8VDR7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TgdsQ8VDR7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TgdsQ8VDR7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TgdsQ8VDR7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TgdsQ8VDR7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TgdsQ8VDR7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TgdsQ8VDR7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TgdsQ8VDR7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TgdsQ8VDR7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TgdsQ8VDR7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TgdsQ8VDR7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TgdsQ8VDR7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TgdsQ8VDR7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TgdsQ8VDR7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TgdsQ8VDR7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TgdsQ8VDR7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TgdsQ8VDR7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TgdsQ8VDR7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TgdsQ8VDR7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TgdsQ8VDR7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TgdsQ8VDR7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TgdsQ8VDR7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TgdsQ8VDR7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TgdsQ8VDR7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TgdsQ8VDR7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TgdsQ8VDR7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TgdsQ8VDR7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TgdsQ8VDR7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TgdsQ8VDR7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TgdsQ8VDR7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TgdsQ8VDR7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TgdsQ8VDR7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TgdsQ8VDR7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
TgdsQ8VDR7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TgdsQ8VDR7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TgdsQ8VDR7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TgdsQ8VDR7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TgdsQ8VDR7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TgdsQ8VDR7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TgdsQ8VDR7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TgdsQ8VDR7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TgdsQ8VDR7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TgdsQ8VDR7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TgdsQ8VDR7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TgdsQ8VDR7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TgdsQ8VDR7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TgdsQ8VDR7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TgdsQ8VDR7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TgdsQ8VDR7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TgdsQ8VDR7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TgdsQ8VDR7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TgdsQ8VDR7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TgdsQ8VDR7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TgdsQ8VDR7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TgdsQ8VDR7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TgdsQ8VDR7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TgdsQ8VDR7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TgdsQ8VDR7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TgdsQ8VDR7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TgdsQ8VDR7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TgdsQ8VDR7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TgdsQ8VDR7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TgdsQ8VDR7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TgdsQ8VDR7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TgdsQ8VDR7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TgdsQ8VDR7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TgdsQ8VDR7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TgdsQ8VDR7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TgdsQ8VDR7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TgdsQ8VDR7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TgdsQ8VDR7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TgdsQ8VDR7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TgdsQ8VDR7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TgdsQ8VDR7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TgdsQ8VDR7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TgdsQ8VDR7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TgdsQ8VDR7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TgdsQ8VDR7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TgdsQ8VDR7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TgdsQ8VDR7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TgdsQ8VDR7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TgdsQ8VDR7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TgdsQ8VDR7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TgdsQ8VDR7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TgdsQ8VDR7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TgdsQ8VDR7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TgdsQ8VDR7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TgdsQ8VDR7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TgdsQ8VDR7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms