Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X3

Stn1, CST complex subunit STN1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stn1Q8K2X3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Stn1Q8K2X3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Stn1Q8K2X3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Stn1Q8K2X3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Stn1Q8K2X3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Stn1Q8K2X3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Stn1Q8K2X3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Stn1Q8K2X3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Stn1Q8K2X3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Stn1Q8K2X3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Stn1Q8K2X3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Stn1Q8K2X3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Stn1Q8K2X3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Stn1Q8K2X3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Stn1Q8K2X3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Stn1Q8K2X3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Stn1Q8K2X3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Stn1Q8K2X3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Stn1Q8K2X3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Stn1Q8K2X3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Stn1Q8K2X3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Stn1Q8K2X3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Stn1Q8K2X3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Stn1Q8K2X3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Stn1Q8K2X3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Stn1Q8K2X3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Stn1Q8K2X3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Stn1Q8K2X3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Stn1Q8K2X3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Stn1Q8K2X3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Stn1Q8K2X3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Stn1Q8K2X3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Stn1Q8K2X3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Stn1Q8K2X3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Stn1Q8K2X3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Stn1Q8K2X3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Stn1Q8K2X3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Stn1Q8K2X3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Stn1Q8K2X3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Stn1Q8K2X3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Stn1Q8K2X3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Stn1Q8K2X3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Stn1Q8K2X3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Stn1Q8K2X3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Stn1Q8K2X3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Stn1Q8K2X3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Stn1Q8K2X3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Stn1Q8K2X3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Stn1Q8K2X3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Stn1Q8K2X3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Stn1Q8K2X3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Stn1Q8K2X3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Stn1Q8K2X3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Stn1Q8K2X3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Stn1Q8K2X3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Stn1Q8K2X3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Stn1Q8K2X3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Stn1Q8K2X3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Stn1Q8K2X3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Stn1Q8K2X3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Stn1Q8K2X3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Stn1Q8K2X3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Stn1Q8K2X3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Stn1Q8K2X3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Stn1Q8K2X3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Stn1Q8K2X3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Stn1Q8K2X3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Stn1Q8K2X3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Stn1Q8K2X3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Stn1Q8K2X3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Stn1Q8K2X3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Stn1Q8K2X3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Stn1Q8K2X3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Stn1Q8K2X3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Stn1Q8K2X3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Stn1Q8K2X3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Stn1Q8K2X3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Stn1Q8K2X3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Stn1Q8K2X3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Stn1Q8K2X3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Stn1Q8K2X3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Stn1Q8K2X3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Stn1Q8K2X3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Stn1Q8K2X3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Stn1Q8K2X3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Stn1Q8K2X3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Stn1Q8K2X3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Stn1Q8K2X3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Stn1Q8K2X3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Stn1Q8K2X3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Stn1Q8K2X3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Stn1Q8K2X3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Stn1Q8K2X3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Stn1Q8K2X3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Stn1Q8K2X3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Stn1Q8K2X3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Stn1Q8K2X3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Stn1Q8K2X3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Stn1Q8K2X3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Stn1Q8K2X3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms