Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD19

Lancl3, LanC-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl3Q8CD19 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lancl3Q8CD19 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lancl3Q8CD19 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lancl3Q8CD19 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Lancl3Q8CD19 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lancl3Q8CD19 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lancl3Q8CD19 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Lancl3Q8CD19 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lancl3Q8CD19 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lancl3Q8CD19 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lancl3Q8CD19 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lancl3Q8CD19 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lancl3Q8CD19 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lancl3Q8CD19 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lancl3Q8CD19 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lancl3Q8CD19 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lancl3Q8CD19 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lancl3Q8CD19 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lancl3Q8CD19 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lancl3Q8CD19 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lancl3Q8CD19 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Lancl3Q8CD19 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lancl3Q8CD19 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lancl3Q8CD19 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lancl3Q8CD19 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lancl3Q8CD19 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lancl3Q8CD19 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lancl3Q8CD19 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lancl3Q8CD19 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lancl3Q8CD19 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lancl3Q8CD19 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lancl3Q8CD19 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lancl3Q8CD19 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lancl3Q8CD19 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lancl3Q8CD19 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lancl3Q8CD19 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lancl3Q8CD19 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lancl3Q8CD19 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lancl3Q8CD19 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lancl3Q8CD19 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Lancl3Q8CD19 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lancl3Q8CD19 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lancl3Q8CD19 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lancl3Q8CD19 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lancl3Q8CD19 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lancl3Q8CD19 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lancl3Q8CD19 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lancl3Q8CD19 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Lancl3Q8CD19 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lancl3Q8CD19 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lancl3Q8CD19 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lancl3Q8CD19 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lancl3Q8CD19 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lancl3Q8CD19 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lancl3Q8CD19 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Lancl3Q8CD19 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Lancl3Q8CD19 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lancl3Q8CD19 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lancl3Q8CD19 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lancl3Q8CD19 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lancl3Q8CD19 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Lancl3Q8CD19 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lancl3Q8CD19 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lancl3Q8CD19 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Lancl3Q8CD19 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lancl3Q8CD19 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lancl3Q8CD19 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lancl3Q8CD19 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lancl3Q8CD19 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lancl3Q8CD19 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lancl3Q8CD19 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lancl3Q8CD19 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lancl3Q8CD19 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lancl3Q8CD19 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lancl3Q8CD19 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lancl3Q8CD19 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lancl3Q8CD19 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lancl3Q8CD19 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lancl3Q8CD19 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Lancl3Q8CD19 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lancl3Q8CD19 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lancl3Q8CD19 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lancl3Q8CD19 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lancl3Q8CD19 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lancl3Q8CD19 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lancl3Q8CD19 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lancl3Q8CD19 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lancl3Q8CD19 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lancl3Q8CD19 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lancl3Q8CD19 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lancl3Q8CD19 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lancl3Q8CD19 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lancl3Q8CD19 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lancl3Q8CD19 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Lancl3Q8CD19 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lancl3Q8CD19 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lancl3Q8CD19 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lancl3Q8CD19 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lancl3Q8CD19 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Lancl3Q8CD19 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms