Protein–RNA interactions for Protein: Q8C886

Plekhn1, Probable pleckstrin homology domain-containing family N member 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plekhn1Q8C886 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Plekhn1Q8C886 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Plekhn1Q8C886 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Plekhn1Q8C886 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Plekhn1Q8C886 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Plekhn1Q8C886 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Plekhn1Q8C886 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Plekhn1Q8C886 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Plekhn1Q8C886 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Plekhn1Q8C886 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Plekhn1Q8C886 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Plekhn1Q8C886 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Plekhn1Q8C886 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Plekhn1Q8C886 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Plekhn1Q8C886 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Plekhn1Q8C886 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Plekhn1Q8C886 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Plekhn1Q8C886 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Plekhn1Q8C886 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Plekhn1Q8C886 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Plekhn1Q8C886 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Plekhn1Q8C886 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Plekhn1Q8C886 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Plekhn1Q8C886 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Plekhn1Q8C886 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Plekhn1Q8C886 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Plekhn1Q8C886 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Plekhn1Q8C886 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Plekhn1Q8C886 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Plekhn1Q8C886 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Plekhn1Q8C886 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Plekhn1Q8C886 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Plekhn1Q8C886 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Plekhn1Q8C886 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Plekhn1Q8C886 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Plekhn1Q8C886 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Plekhn1Q8C886 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Plekhn1Q8C886 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Plekhn1Q8C886 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Plekhn1Q8C886 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Plekhn1Q8C886 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Plekhn1Q8C886 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Plekhn1Q8C886 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Plekhn1Q8C886 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Plekhn1Q8C886 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Plekhn1Q8C886 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Plekhn1Q8C886 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Plekhn1Q8C886 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Plekhn1Q8C886 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Plekhn1Q8C886 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Plekhn1Q8C886 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Plekhn1Q8C886 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Plekhn1Q8C886 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Plekhn1Q8C886 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Plekhn1Q8C886 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Plekhn1Q8C886 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Plekhn1Q8C886 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Plekhn1Q8C886 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Plekhn1Q8C886 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Plekhn1Q8C886 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Plekhn1Q8C886 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Plekhn1Q8C886 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Plekhn1Q8C886 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Plekhn1Q8C886 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Plekhn1Q8C886 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Plekhn1Q8C886 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Plekhn1Q8C886 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Plekhn1Q8C886 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Plekhn1Q8C886 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Plekhn1Q8C886 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Plekhn1Q8C886 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Plekhn1Q8C886 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Plekhn1Q8C886 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Plekhn1Q8C886 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Plekhn1Q8C886 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Plekhn1Q8C886 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Plekhn1Q8C886 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Plekhn1Q8C886 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Plekhn1Q8C886 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Plekhn1Q8C886 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Plekhn1Q8C886 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Plekhn1Q8C886 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Plekhn1Q8C886 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Plekhn1Q8C886 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Plekhn1Q8C886 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Plekhn1Q8C886 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Plekhn1Q8C886 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Plekhn1Q8C886 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Plekhn1Q8C886 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Plekhn1Q8C886 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Plekhn1Q8C886 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Plekhn1Q8C886 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Plekhn1Q8C886 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Plekhn1Q8C886 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Plekhn1Q8C886 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Plekhn1Q8C886 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Plekhn1Q8C886 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Plekhn1Q8C886 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Plekhn1Q8C886 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Plekhn1Q8C886 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms