Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3F7

Klhl30, Kelch-like protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl30Q8C3F7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Klhl30Q8C3F7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Klhl30Q8C3F7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Klhl30Q8C3F7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Klhl30Q8C3F7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Klhl30Q8C3F7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Klhl30Q8C3F7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Klhl30Q8C3F7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Klhl30Q8C3F7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Klhl30Q8C3F7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Klhl30Q8C3F7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Klhl30Q8C3F7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Klhl30Q8C3F7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Klhl30Q8C3F7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Klhl30Q8C3F7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Klhl30Q8C3F7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Klhl30Q8C3F7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Klhl30Q8C3F7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Klhl30Q8C3F7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Klhl30Q8C3F7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Klhl30Q8C3F7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Klhl30Q8C3F7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Klhl30Q8C3F7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Klhl30Q8C3F7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Klhl30Q8C3F7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Klhl30Q8C3F7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Klhl30Q8C3F7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Klhl30Q8C3F7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Klhl30Q8C3F7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Klhl30Q8C3F7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Klhl30Q8C3F7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Klhl30Q8C3F7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Klhl30Q8C3F7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Klhl30Q8C3F7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Klhl30Q8C3F7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Klhl30Q8C3F7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Klhl30Q8C3F7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Klhl30Q8C3F7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Klhl30Q8C3F7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Klhl30Q8C3F7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Klhl30Q8C3F7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Klhl30Q8C3F7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Klhl30Q8C3F7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Klhl30Q8C3F7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Klhl30Q8C3F7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Klhl30Q8C3F7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Klhl30Q8C3F7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Klhl30Q8C3F7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Klhl30Q8C3F7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Klhl30Q8C3F7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Klhl30Q8C3F7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Klhl30Q8C3F7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Klhl30Q8C3F7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Klhl30Q8C3F7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Klhl30Q8C3F7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Klhl30Q8C3F7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Klhl30Q8C3F7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Klhl30Q8C3F7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Klhl30Q8C3F7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Klhl30Q8C3F7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Klhl30Q8C3F7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Klhl30Q8C3F7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Klhl30Q8C3F7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Klhl30Q8C3F7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Klhl30Q8C3F7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Klhl30Q8C3F7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Klhl30Q8C3F7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Klhl30Q8C3F7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Klhl30Q8C3F7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Klhl30Q8C3F7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Klhl30Q8C3F7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Klhl30Q8C3F7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Klhl30Q8C3F7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Klhl30Q8C3F7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Klhl30Q8C3F7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Klhl30Q8C3F7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Klhl30Q8C3F7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Klhl30Q8C3F7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Klhl30Q8C3F7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Klhl30Q8C3F7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Klhl30Q8C3F7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Klhl30Q8C3F7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Klhl30Q8C3F7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Klhl30Q8C3F7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Klhl30Q8C3F7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Klhl30Q8C3F7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Klhl30Q8C3F7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Klhl30Q8C3F7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Klhl30Q8C3F7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Klhl30Q8C3F7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Klhl30Q8C3F7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Klhl30Q8C3F7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Klhl30Q8C3F7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Klhl30Q8C3F7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Klhl30Q8C3F7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Klhl30Q8C3F7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Klhl30Q8C3F7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Klhl30Q8C3F7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Klhl30Q8C3F7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Klhl30Q8C3F7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms