Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLE7

Slc17a6, Vesicular glutamate transporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc17a6Q8BLE7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc17a6Q8BLE7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc17a6Q8BLE7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc17a6Q8BLE7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc17a6Q8BLE7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc17a6Q8BLE7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc17a6Q8BLE7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc17a6Q8BLE7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc17a6Q8BLE7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc17a6Q8BLE7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc17a6Q8BLE7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc17a6Q8BLE7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc17a6Q8BLE7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc17a6Q8BLE7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc17a6Q8BLE7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc17a6Q8BLE7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc17a6Q8BLE7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc17a6Q8BLE7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc17a6Q8BLE7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc17a6Q8BLE7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc17a6Q8BLE7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc17a6Q8BLE7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc17a6Q8BLE7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc17a6Q8BLE7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc17a6Q8BLE7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc17a6Q8BLE7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc17a6Q8BLE7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc17a6Q8BLE7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc17a6Q8BLE7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc17a6Q8BLE7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc17a6Q8BLE7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc17a6Q8BLE7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc17a6Q8BLE7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc17a6Q8BLE7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc17a6Q8BLE7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc17a6Q8BLE7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc17a6Q8BLE7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc17a6Q8BLE7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc17a6Q8BLE7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc17a6Q8BLE7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc17a6Q8BLE7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc17a6Q8BLE7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc17a6Q8BLE7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc17a6Q8BLE7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc17a6Q8BLE7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc17a6Q8BLE7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc17a6Q8BLE7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc17a6Q8BLE7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc17a6Q8BLE7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc17a6Q8BLE7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc17a6Q8BLE7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc17a6Q8BLE7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc17a6Q8BLE7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc17a6Q8BLE7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc17a6Q8BLE7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc17a6Q8BLE7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc17a6Q8BLE7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc17a6Q8BLE7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc17a6Q8BLE7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc17a6Q8BLE7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc17a6Q8BLE7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc17a6Q8BLE7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc17a6Q8BLE7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc17a6Q8BLE7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc17a6Q8BLE7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc17a6Q8BLE7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc17a6Q8BLE7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc17a6Q8BLE7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc17a6Q8BLE7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc17a6Q8BLE7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc17a6Q8BLE7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc17a6Q8BLE7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc17a6Q8BLE7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc17a6Q8BLE7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc17a6Q8BLE7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc17a6Q8BLE7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc17a6Q8BLE7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc17a6Q8BLE7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc17a6Q8BLE7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc17a6Q8BLE7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc17a6Q8BLE7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc17a6Q8BLE7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc17a6Q8BLE7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc17a6Q8BLE7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc17a6Q8BLE7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc17a6Q8BLE7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc17a6Q8BLE7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc17a6Q8BLE7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc17a6Q8BLE7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc17a6Q8BLE7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc17a6Q8BLE7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc17a6Q8BLE7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slc17a6Q8BLE7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc17a6Q8BLE7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc17a6Q8BLE7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc17a6Q8BLE7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc17a6Q8BLE7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc17a6Q8BLE7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc17a6Q8BLE7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc17a6Q8BLE7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms