Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGN2

D3Ertd751e, UPF0462 protein C4orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D3Ertd751eQ8BGN2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
D3Ertd751eQ8BGN2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
D3Ertd751eQ8BGN2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
D3Ertd751eQ8BGN2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
D3Ertd751eQ8BGN2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
D3Ertd751eQ8BGN2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
D3Ertd751eQ8BGN2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
D3Ertd751eQ8BGN2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
D3Ertd751eQ8BGN2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
D3Ertd751eQ8BGN2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
D3Ertd751eQ8BGN2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
D3Ertd751eQ8BGN2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
D3Ertd751eQ8BGN2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
D3Ertd751eQ8BGN2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
D3Ertd751eQ8BGN2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
D3Ertd751eQ8BGN2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
D3Ertd751eQ8BGN2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
D3Ertd751eQ8BGN2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
D3Ertd751eQ8BGN2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
D3Ertd751eQ8BGN2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
D3Ertd751eQ8BGN2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
D3Ertd751eQ8BGN2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
D3Ertd751eQ8BGN2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
D3Ertd751eQ8BGN2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
D3Ertd751eQ8BGN2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
D3Ertd751eQ8BGN2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
D3Ertd751eQ8BGN2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
D3Ertd751eQ8BGN2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
D3Ertd751eQ8BGN2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
D3Ertd751eQ8BGN2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
D3Ertd751eQ8BGN2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
D3Ertd751eQ8BGN2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
D3Ertd751eQ8BGN2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
D3Ertd751eQ8BGN2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
D3Ertd751eQ8BGN2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
D3Ertd751eQ8BGN2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
D3Ertd751eQ8BGN2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
D3Ertd751eQ8BGN2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
D3Ertd751eQ8BGN2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
D3Ertd751eQ8BGN2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
D3Ertd751eQ8BGN2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
D3Ertd751eQ8BGN2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
D3Ertd751eQ8BGN2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
D3Ertd751eQ8BGN2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
D3Ertd751eQ8BGN2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
D3Ertd751eQ8BGN2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
D3Ertd751eQ8BGN2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
D3Ertd751eQ8BGN2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
D3Ertd751eQ8BGN2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
D3Ertd751eQ8BGN2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
D3Ertd751eQ8BGN2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
D3Ertd751eQ8BGN2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
D3Ertd751eQ8BGN2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
D3Ertd751eQ8BGN2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
D3Ertd751eQ8BGN2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
D3Ertd751eQ8BGN2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
D3Ertd751eQ8BGN2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
D3Ertd751eQ8BGN2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
D3Ertd751eQ8BGN2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
D3Ertd751eQ8BGN2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
D3Ertd751eQ8BGN2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
D3Ertd751eQ8BGN2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
D3Ertd751eQ8BGN2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
D3Ertd751eQ8BGN2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
D3Ertd751eQ8BGN2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
D3Ertd751eQ8BGN2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
D3Ertd751eQ8BGN2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
D3Ertd751eQ8BGN2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
D3Ertd751eQ8BGN2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
D3Ertd751eQ8BGN2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
D3Ertd751eQ8BGN2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
D3Ertd751eQ8BGN2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
D3Ertd751eQ8BGN2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
D3Ertd751eQ8BGN2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
D3Ertd751eQ8BGN2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
D3Ertd751eQ8BGN2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
D3Ertd751eQ8BGN2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
D3Ertd751eQ8BGN2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
D3Ertd751eQ8BGN2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
D3Ertd751eQ8BGN2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
D3Ertd751eQ8BGN2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
D3Ertd751eQ8BGN2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
D3Ertd751eQ8BGN2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
D3Ertd751eQ8BGN2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
D3Ertd751eQ8BGN2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
D3Ertd751eQ8BGN2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
D3Ertd751eQ8BGN2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
D3Ertd751eQ8BGN2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
D3Ertd751eQ8BGN2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
D3Ertd751eQ8BGN2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
D3Ertd751eQ8BGN2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
D3Ertd751eQ8BGN2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
D3Ertd751eQ8BGN2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
D3Ertd751eQ8BGN2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
D3Ertd751eQ8BGN2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
D3Ertd751eQ8BGN2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
D3Ertd751eQ8BGN2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
D3Ertd751eQ8BGN2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
D3Ertd751eQ8BGN2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
D3Ertd751eQ8BGN2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms